支持向量机与混合专家神经网络在生物医学中的应用
在生物医学领域,准确分类G蛋白偶联受体(GPCRs)以及有效控制糖尿病患者的血糖水平是两个重要的研究方向。本文将介绍支持向量机(SVM)在GPCRs分类中的应用,以及基于混合专家(MOE)神经网络的个体血糖控制模型(IBGCM)的设计与实现。
支持向量机分类G蛋白偶联受体
GPCRs在人体生理过程中起着关键作用,对其进行准确分类有助于深入理解其功能和相关疾病的发病机制。本研究采用支持向量机方法对GPCRs进行分类。
材料与方法
-
序列数据 :使用与Erlod和Chou相同的数据集,该数据集来自GPCRDB(2000年12月发布)。其中包含167个视紫红质样胺G蛋白偶联受体,分为乙酰胆碱、肾上腺素能受体、多巴胺和血清素四类,具体信息如下表所示:
| 类别 | 序列数量 | 平均长度 |
| ---- | ---- | ---- |
| 乙酰胆碱 | 31 | 530.6 |
| 肾上腺素能受体 | 44 | 448.4 |
| 多巴胺 | 38 | 441.4 |
| 血清素 | 54 | 433.7 |
| 总体 | 167 | 457.3 | -
数据表示 :蛋白质序列由20种不同的氨基酸组成。为了应用SVM等机器学习方法,需要从可变长度的蛋白质序列中提取固定长度的特征向量。本研究采用Chou的方法,将蛋白质表示为其氨基酸组成,对应于20维空间中的向量:
[
X_k =
\be
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