Annovar报错: `Argument “G“ isn‘t numeric in numeric eq (==) at ./annotate_variation.pl line 2583, <DB>

当使用Annovar软件注释VCF文件时,遇到Argument "G" isn't numeric in numeric eq (==) at ./annotate_variation.pl line 2583的错误。问题源于数据库文件名不匹配。解决方案是解压缩下载的数据,将文件重命名为符合要求的名称,然后使用正确的注释命令进行操作。

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如何解决Argument “G” isn’t numeric in numeric eq (==) at ./annotate_variation.pl line 2583, line 768929的Annovar软件报错.

当我们尝试使用Annovar软件(下载链接:https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/)中提供的数据库如千人基因组1000genome(下载链接:http://www.openbioinformatics.org/annovar/download/hg19_1000g2012apr.zip
)注释VCF的时候,遇到如下错误:

Annovar注释的bug
这种状态其实是没有在注释的,而且不会得到注释结果,是错误的状态。

那么如何解决那?解决方案如下:

首先我们将下载好的数据,是需要解压缩的࿰

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