t-SNE和PCA进行数据降维和聚类的比较

文章对比了PCA和t-SNE两种数据降维方法在处理mnist图像数据上的效果。PCA作为线性降维手段,保留了样本方差,但在可视化和KMeans聚类中表现一般。而t-SNE虽然计算慢且结果有随机性,但能提供更好的数据可视化分离效果,尤其适合降维到2维或3维。在无监督学习中,t-SNE可能带来意想不到的聚类效果。

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PCA(主成分分析)通过对原始数据特征的线性组合,在尽可能保留样本之间差异性(样本方差)的情况下,形成新的特征,是最常见的数据降维手段。

t-SNE(t-distributed stochastic neighbor embedding)是一种非线性的数据降维方法,它将数据点之间的空间距离转化为相似度的概率分布(高维空间中使用高斯分布,低维空间中使用t-分布),通过最小化高维空间和低维空间概率分布的KL散度,获得数据在低维空间中的近似。通常用于高维数据的可视化。

本文分别使用t-SNE和PCA对mnist图像数据进行降维处理,再对降维后的数据进行KMeans聚类,对比其降维效果的差异。

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.datasets import load_digits

data, labels = load_digits(return_X_y=True)    # 加载mnist数据
(n_samples, n_features), n_digits = data.shape, np.unique(labels).size


fig, axs = plt.subplots(nrows=10, ncols=10, figsize=(6, 6))
for idx, ax in enumerate(axs.ravel()):
    ax.imshow(data[idx].reshape((8, 8)), cmap=plt.cm.binary)
    ax.axis("off")
_ = fig.suptitle("A selection from the 64-dimensional digits dataset"
### 回答1: 数据通常被认为是数据挖掘机器学习中的重要工具。它的目的是在不丢失太多信息的情况下减少数据数以便于处理。PCAt-SNE是两种常见的技术。下面我们来看看它们之间的区别: PCA(Principal Component Analysis,主成分分析)是一种线性方法。它通过线性变换将高数据映射到低空间,保留尽可能多的原始数据的信息。在PCA中,数据由它的主成分分析的线性组合表示。主成分分析能有效地捕捉到数据的方差结构,但是它可能会忽略重要的非线性结构。PCA不适合用于非线性数据集的。 t-SNE(t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding,t分布随机邻居嵌入)是一种非线性方法。它能够有效地处理高空间中的非线性关系,并可将这些关系表现在低空间中。t-SNE能够用来发现数据的嵌入模式,它考虑到每个领域中的所有点,而不仅仅是最近邻点。但是t-SNE计算复杂度较高,需要大量的计算时间内存资源。 综上所述,PCAt-SNE是两种不同的方法PCA是一种线性方法,适合于线性数据集。t-SNE是一种非线性方法,适合于非线性数据集。在选择方法时,应该根据数据的结构目的来选择。 ### 回答2: tsnepca都是常用的方法,它们的目的都是将高数据映射到一个低空间,以便于可视化数据分析。 首先,tsnepca方式不同。pca基于数据的协方差矩阵,通过对其进行特征值分解来得到主成分,也就是数据投影后的新坐标轴。而tsne基于高数据的相似性度量,通过在低空间中最小化样本间的KL距离,来将高数据映射为低表示。 其次,tsnepca效果也有所不同。pca主要关注保持原有数据的方差,将方差大的特征投影到主成分上,保留最显著的信息。相较而言,tsne基于局部相似度的聚类,更适用于寻找数据中的团簇结构(类似于k-means 算法),得到的结果更具有可解释性、更适用于数据分类、聚类数据挖掘任务。 再次,tsne的计算比pca更慢。由于tsne相比于pca多了一个KL散度的计算,同时将高空间中的相似性转化为低空间中的概率分布,因此tsne算法计算的复杂度时间更高。不过,tsne得到的结果比pca更具有可解释性,同时也能更好地反映数据中的局部结构。 总之,tsnepca都是常用的方法,并且在不同的应用场景中有不同的表现优劣。在实际应用中,需要根据具体问题的需求来选择适合的方法。 ### 回答3: PCA(Principal Component Analysis)t-SNE(t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding)是常见的方法。它们都是将高数据转换为低表示,以便于数据处理可视化。下面来介绍一下它们的主要区别。 首先,PCA是一种线性方法,它的主要思想是找到使得数据方差最大的方向,然后将数据投影到这个方向上得到一个新的一(或多)空间,如下图所示: ![PCA Demo](https://i.imgur.com/LvOinjD.png) 在这个新的一空间中,数据之间的距离可以被保留,但是数据的原始特征会被丢失。而t-SNE则是一种非线性方法,它的主要思想是将高数据映射到低空间中,同时保持数据之间局部距离的相对关系,全局距离的相对关系则可以被忽略。如下图所示: ![t-SNE Demo](https://i.imgur.com/4QoovV9.png) 可以看到,在低空间中,数据点之间的距离关系可能会被扭曲,但是相对的局部距离关系被保留。 其次,PCAt-SNE的应用场景也有所不同。PCA适用于线性数据,尤其是在大量样本数据中找到主成分进行压缩;而t-SNE主要适用于高数据聚类分析、可视化、异常值检测等,尤其是当数据之间的相对位置关系比较重要时。 再次,PCAt-SNE在计算速度上也有一定区别。PCA可以使用特征值分解等一些快速算法进行计算,速度相对较快;而t-SNE的计算速度较慢,尤其在大规模数据处理时需要较长时间。 总之,PCAt-SNE的基本思路、适用场景计算速度等方面存在差异。在具体应用时需要根据数据类型处理目的选择合适的方法
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