Flexpart-WRF安装过程记录

Tsumugi_Kotobuki

已于 2025-01-05 12:58:47 修改

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文章标签： linux

于 2024-12-25 01:52:43 首次发布

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/Tsumugi_Kotobuki/article/details/144706249

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由于研究工作需要，我在实验组的服务器上已经安装过了WRF“全家桶”，这里参考了文章

WRF安装和运行的技术教程-优快云博客

此外需要安装Flexpart-WRF来搭配使用。但是也许是因为Flexpart-WRF相比Flexpart来说比较小众，在互联网上Search了一圈也没找到几篇相关的内容，有几个比较细节的坑也就只能自己填了。这里就记录了我在安装Flexpart-WRF的过程以及遇到的部分问题，以起到抛砖引玉之效。

一，下载和安装

从官网上下载源码包并解压（下面的是zip包链接）即可：

https://git.nilu.no/flexpart/flexpart-wrf/-/archive/master/flexpart-wrf-master.zip

此后你会看到一个文件夹名为“flexpart-wrf-master”, 执行命令进入这个文件夹：

cd flexpart-wrf-master

编译过程的规则文件（Makefile）是makefile.mom，我们要根据情况手动修改它（我用的文本编辑器是vim）：

vim makefile.mom

注意提供netcdf库的位置。

SHELL = /bin/bash
## name of the executable
EXECNAME = flexwrf33
#
############## NETCDF library path #################
#NETCDF = /wrk/d0/jbrioude/netcdf-3.6.2/lib
NETCDF = ‘这里是你的netcdf库的路径’

# NetCDF library version 3 or 4. Version 4 is much better for compression
NETCDFVERSION=3

不要受上面的这条注释误导，这个路径一般就是"/.../.../netcdf"这样的形式，下面有bin、lib、include等文件夹，一般最后不带“/lib” 。比如我之前照着教程安装过WRF，这里我写的是

NETCDF = ~/Build-WRF/LIBRARIES/netcdf

接下来注意你安装的netcdf库时的要求：是否启用了netcdf4格式的支持，如果是，则NETCDFVERSION一行写4，否则写3。

接下来是选择编译器，根据自己情况来选，注意要和你编译netcdf等的编译器系列一致！

############### Specify the compiler you want
# COMPILER options --- gnu, pgi, intel
COMPILER = gnu

文件后面的部分就非必要不修改了。但是遇到了问题需要debug，就得动手修改一些东西了。

接下来开始编译，根据说明文档：

make -f makefile.mom mpi  for MPI+OPENMP hybrid run
make -f makefile.mom omp  for OPENMP parallel run
make -f makefile.mom serial for a serial run

选择并行还是串行。我选的是GNU编译器+串行。编译完成后会在当前路径生成一个文件： “flexwrf33_gnu_serial”（文件名会由于编译器和运行形式有所不同）。这就是最终需要的可执行文件了。

二，可能遇到的问题

我安装的netcdf库是分成两个部分：netcdf-c (版本4.7.2) 和netcdf-fortran（版本4.5.2）是比较新的版本，而且由于我用的是GNU编译器，而且版本较新（GNU Fortran (Ubuntu 11.4.0-1ubuntu1~22.04) 11.4.0
）在编译一些Fortran文件时会有些许问题。

1，即使NETCDF库路径正确也提示报错：找不到“netcdf.mod”文件。推测是因为netcdf库版本导致的问题。因此这个需要在GNU_GNU_LDFLAGS一行最后增加“-lnetcdf”，使其能正常导入.。

2，“Rank mismatch” 开头的一类报错

出现此类报错，是由于gfortran版本较新导致（如果要深究可以参考这里）。需要在GNU_FFLAGS一行最后增加“-fallow-argument-mismatch”，使其忽略报错。

3，“BOZ literal constant”开头的一类报错

出现此类报错，需要在GNU_FFLAGS一行最后再增加“-fallow-invalid-boz”，使其忽略报错。