基于LIRI基因数据集的R语言应用：自定义高风险组和低风险组

基于LIRI基因数据集的R语言应用：自定义高风险组和低风险组

在生物学研究中，基因表达数据分析是一个重要的研究领域。LIRI基因数据集是一个常用的基因表达数据集，我们将使用R语言来分析该数据集，并自定义高风险组和低风险组。

首先，我们需要加载所需的R包，并读取LIRI基因数据集。

# 加载所需的R包
library(plyr)
library(ggplot2)

# 读取LIRI基因数据集
liri_data <- read.csv("liri_gene_expression.csv", header = TRUE)

接下来，我们可以探索数据集的结构和内容。可以使用以下代码查看数据集的前几行和列名。

# 查看数据集的前几行和列名
head(liri_data)

接下来，我们可以对数据集进行预处理，以便为后续分析做准备。我们可以去除缺失值和不必要的列，并对基因表达值进行归一化。

# 去除缺失值
liri_data <- na.omit(liri_data)

# 去除不必要的列
liri_data <- subset(liri_data, select = -c(Column1, Column2))

# 对基因表达值进行归一化
normalized_data <- apply(liri_data[, -1], 2, function(x) (x - min(x))/(max(x) - min(x)))