基于LIRI基因数据集的R语言应用:自定义高风险组和低风险组

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本文利用R语言对LIRI基因数据集进行分析,通过预处理数据、定义基于基因A和基因B表达水平的高风险组与低风险组,并绘制散点图展示其表达分布,揭示样本群体间的差异,为生物学研究提供参考。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

基于LIRI基因数据集的R语言应用:自定义高风险组和低风险组

在生物学研究中,基因表达数据分析是一个重要的研究领域。LIRI基因数据集是一个常用的基因表达数据集,我们将使用R语言来分析该数据集,并自定义高风险组和低风险组。

首先,我们需要加载所需的R包,并读取LIRI基因数据集。

# 加载所需的R包
library(plyr)
library(ggplot2)

# 读取LIRI基因数据集
liri_data <- read.csv("liri_gene_expression.csv", header = TRUE)

接下来,我们可以探索数据集的结构和内容。可以使用以下代码查看数据集的前几行和列名。

# 查看数据集的前几行和列名
head(liri_data)

接下来,我们可以对数据集进行预处理,以便为后续分析做准备。我们可以去除缺失值和不必要的列,并对基因表达值进行归一化。

# 去除缺失值
liri_data <- na.omit(liri_data)

# 去除不必要的列
liri_data <- subset(liri_data, select = -c(Column1, Column2))

# 对基因表达值进行归一化
norma
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