Vancouver Machine Learning 2019 参会记录

本文记录了Vancouver Machine Learning 2019会议的主要内容,涉及蛋白质检测的机器学习方法、使用贝叶斯方法重建单细胞谱系树以及在线病原体识别平台。会议涵盖了蛋白质设计优化、群体样本中Identity by Descent(IBD)段的寻找以及大规模数据下的生物信息学应用。

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VanML 2019 参会记录

紧接着 NeurIPS 2019 会议后面,就是 Vancouver Machine Learning: Genomics 会议。其实本次算是我第一次参加学术会议,
本科的时候也有一次机会,当时 Nature 的子会议 Agricultural Genomics 2017 在我农的作物遗传改良国家重点实验室开,我是可以去听的(如果我想的话),
但最后还是没有成行。大概是因为当时忙于准备数学建模竞赛,这两件事正好一前一后,所以国赛已结束我直接累的不想干任何事了。

言归正传,这个会议还是非常专业项的,而且是纯研讨性质。小而精的感觉。我学到了不少领域内别的大牛都在做什么方向,用了什么方法。收获颇多吧(而且吃的是真的不错 ԅ(¯﹃¯ԅ))

行程

15 日中午到达港口,乘渡轮到达温哥华。

去码头沿途风景
去码头沿途风景
到达 Terminal到达 Terminal
渡轮
渡轮
途中
途中
海上风景
海上风景
到达温哥华
到达温哥华

晚上真冷啊,街上都没几个人
晚上真冷啊,街上都没几个人

正式会议

SFU开会

First session

Dr. Jennifer Listgarten, Professor in the Electrical Engineering and Computer Sciences department and the Center for Computational Biology at Berkeley.

Theme: Machine Learning in protein detection.

Major Problems and Objectives

  • Protein we want to search
    • Problem: massive search space, 10L space, and when L ~ 50 the amount is close to atoms in outer space. And yet, L gets larger.
  • Protei
### Zotero Vancouver 引用样式配置与使用 #### 配置Vancouver引用样式 为了在Zotero中应用Vancouver引用样式,需访问Zotero Style Repository获取所需的.csl文件。这个仓库提供了大量适用于不同学科和期刊的引用格式模板[^1]。 一旦找到匹配的Vancouver风格文件后,可以通过点击页面上的链接来下载对应的.csl文件至本地计算机。接着,在Zotero软件内通过“编辑”菜单下的“偏好设置”,再选择“管理样式”的选项打开样式管理窗口;利用此界面中的按钮上传先前保存下来的.csl文档完成安装过程。 #### 使用已配置好的Vancouver引用样式 当成功添加了特定版本的Vancouver引用样式之后,便可以在创建新条目或是修改已有文献记录时选用它作为默认显示模式。对于Word处理工具而言,则可通过插件实现自动化的文献引用功能——只需按照提示操作即可轻松切换成所期望看到的效果。 此外,如果遇到任何有关于如何正确运用该种引用方式的问题,官方提供的《Zotero Citation 插件使用教程》也能够给予一定的指导和支持。 ```python # 示例Python代码用于展示如何自动化导出带有指定引用样式的BibTeX文件(假设已经安装好了zoterolib库) import zoterolib as zl def export_bibtex_with_style(library_path, output_file='output.bib', style_name='vancouver'): library = zl.ZoteroLibrary(library_path) bibtex_string = library.export_as('bibtex', citation_style=style_name) with open(output_file, 'w') as f: f.write(bibtex_string) export_bibtex_with_style('/path/to/your/zotero/library') ```
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