SLY_SLY_SLY的博客

原创 利用leafcutter做可变剪切（新手向）

本文参考于生信技能树利用leafcutter做可变剪切需要的材料是RNA-seq流程中所获得的bam类型的文件首先是软件的安装：1.源代码下载git clone https://github.com/davidaknowles/leafcutter#这条命令下载该软件的源代码，需要修改里面的一个脚本 scripts/bam2junc.sh 把软件路径增添进去即可，并将该软件路径添加到环境变量中2.软件安装：由于该软件是一个R包所以可以直接在R中安装这个包：if (!require(“devt