万亿原子,毫秒轨迹——LAMMPS本地部署教程:解锁材料演化密码

一、简介

LAMMPS 官方手册

LAMMPS ("Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator",大尺度原子/分子并行模拟工具)是一个经典的分子动力学模拟程序,由桑迪亚国家实验室开发。

LAMMPS 提供了元素周期表中对应原子的经验势函数,能够开展与实际体系相符的分子动力学模拟。例如,可以计算金属铝的晶格常数或水的密度,并获得与实验结果一致的数值。此外,LAMMPS 还提供了多种模型势函数,适用于粗粒化模拟,例如基于粒子-弹簧模型研究高分子链的性质。

LAMMPS当前使用C++编写,早期版本使用Fortran77以及Fortran90。分子模拟方法主要有分子学方法(MM),蒙特卡洛方法(MC)及分子动力学方法(MD)。

二、直接安装

基础版本

sudo apt update && sudo apt upgrade
sudo apt-get install lammps
sudo apt-get install openkim-models

三、cmake编译安装

可选择安装其它包

1、安装编译环境

GPU加速需要CUDA环境,nvcc -V 查看是否安装及版本。

sudo apt-get upda
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