凌恩生物2月客户文章合集

2025年2月，凌恩生物助力客户发表文章81篇，累计影响因子423.2分，其中包括Chemical Engineering Journal、Journal of Hazardous Materials、Gut Microbes、Global Change Biology、Environmental Science & Technology、Genome Biology等期刊文章。此次收录的文章涵盖多个研究方向，其中多组学研究27篇，微生物方向40篇，基因组方向24篇，转录组方向15篇，代谢组方向9篇，宏基因组方向9篇。

接下来小编挑选了一些高分文章，让我们一起回顾一下吧~

01、人工湿地处理废水中致病菌和高风险ARGs的性能评估

题目:Pathogenic bacteria and high-risk ARGs removal in subsurface flow constructed wetlands treating swine tailwater: Performance and influencing factors

发表期刊:Chemical Engineering Journal

影响因子:13.4

作者单位:南京农业大学

涉及的凌恩生物服务产品:二代16S扩增子

主要研究内容 

本研究通过构建小型水平潜流构造湿地（HSFCWs）和垂直潜流构造湿地（VSFCWs）实验系统，并运用16S rRNA测序、多重细菌病原体检测（MBPD）分析等方法，研究了这两种湿地系统处理养猪场废水中病原细菌和高风险抗生素抗性基因（ARGs）的效率和机制。结果显示，HSFCWs和VSFCWs均能有效消除养猪场废水中的病原细菌，且HSFCWs的消除性能优于VSFCWs。然而，出水中仍有病原细菌存在，且发现了新的病原细菌。研究揭示了CWs(构造湿地)在处理养猪场废水中病原细菌和ARGs方面的潜力和限制，并指出环境温度、湿地类型、抗生素和重金属等因素均可影响CWs的处理效率，为养猪场废水的深度处理提供了重要的科学依据。

02、萘普生手性异构体在促进抗生素耐药基因水平转移中的影响

题目:Stereoselective behavior of naproxen chiral enantiomers in promoting horizontal transfer of antibiotic resistance genes

发表期刊:Journal of Hazardous Materials

影响因子:12.2

作者单位:南开大学

涉及的凌恩生物服务产品:宏基因组

主要研究内容

本研究主要探讨了萘普生（NAP）手性对河流生态系统中抗生素抗性基因（ARGs）的综合特征、水平基因转移潜力、宿主以及公共健康风险的影响。采用宏基因组分析的方法，对NAP暴露下的细菌群落进行深入研究，分析了其对ARGs的立体选择性效应。研究结果表明，NAP 选择性地富集ARGs和移动遗传元件（MGE），从而增强细菌对特定抗生素的耐药性。重要的是，NAP 的手性对映异构体的空间变化会影响细菌群落对抗生素的对映选择性反应。此外，研究还发现NAP显著促进了细菌间ARGs的水平转移，其中(R)-NAP的处理组中转移频率高于(S)-NAP。这一发现阐明了ARGs在NAP应激下的水平转移和传递机制，强调了与NAP手性对映异构体相关的潜在健康危害。

03、脯氨酸减轻环丙沙星在环境浓度下诱导的抗生素耐药性演变

题目:Proline mitigates antibiotic resistance evolution induced by ciprofloxacin at environmental concentrations

发表期刊:Journal of Hazardous Materials

影响因子:12.2

作者单位:浙江大学

涉及的凌恩生物服务产品:细菌完成图+原核转录组+单菌单细胞转录组+二代16S扩增子+宏基因组

主要研究内容

本研究主要探讨了脯氨酸对延缓细菌环丙沙星（CIP）抗药发展的作用。利用全基因组测序、转录组学和13C代谢通量分析，揭示了脯氨酸的进化缓解机制，主要涉及TCA循环的基因表达下调和代谢通量减少，从而降低NADH的产生、质子驱动力和环丙沙星的摄取。基于单细胞转录组测序分析，脯氨酸减小了进化的大肠杆菌种群中耐药亚群的大小。基于土壤微观实验，脯氨酸不仅降低了整体抗生素耐药性，而且增加了群落多样性 。通过添加脯氨酸，观察到脯氨酸能够显著降低CIP的摄取量，进而减缓大肠杆菌对CIP抗药性的发展。这一发现为理解脯氨酸在减缓抗生素抗药性发展中的作用提供了新的视角，也提出了一种绿色有效的策略来对抗抗生素抗药性的发展。

04、吲哚-3-丙酸通过上调 Th1/Th17 细胞凋亡来缓解肠粘膜炎症

题目:Microbiota-derived IPA alleviates intestinal mucosal inflammation through upregulating Th1/Th17 cell apoptosis in inflammatory bowel disease

发表期刊:Gut Microbes

影响因子:12.2

作者单位:同济大学

涉及的凌恩生物服务产品:二代16S扩增子+非靶向代谢组+真核有参转录组分析

主要研究内容

本研究运用16S rRNA基因测序技术和代谢组学方法探讨了微生物代谢产物吲哚-3-丙酸（IPA）在炎症性肠病（IBD）患者肠道黏膜炎症中的作用机制。结果显示，IBD患者粪便中IPA浓度显著降低，暗示IPA的缺乏可能与IBD症状的加剧有关。利用转录组学、分子对接模拟和表面等离子体共振分析，发现IPA通过与热休克蛋白70（HSP70）结合，促进CD4+ T细胞凋亡，从而减少了促炎性的Th1和Th17细胞数量，缓解了肠道黏膜炎症。此外，IPA还维持了肠道黏膜屏障的完整性，并调节了肠道免疫反应。这些结果不仅揭示了IPA在IBD中的保护作用，也为IBD的治疗提供了新的潜在靶点，有望为IBD患者带来新的治疗希望。

05、中性红对硫酸盐还原细菌的抑制作用

题目:Potent and Selective Inhibition of Sulfate-Reducing Bacteria by Neutral Red

发表期刊:Environmental Science & Technology

影响因子:10.9

作者单位:哈尔滨工业大学

涉及的凌恩生物服务产品:三代16s扩增子+原核转录组

主要研究内容

本研究通过16S rRNA基因扩增子测序方法，研究中性红对硫酸盐还原菌（SRB）群落结构及其动态变化的影响。结果显示，中性红在发酵条件下仍然是SRB生长的有效抑制剂，并且被硝酸盐还原细菌耐受。转录组学分析显示，中枢硫酸盐还原途径的抑制与中性红对SRB生长的毒性机制有关。此外，两种电子传递复合物（QmoABC和DsrMKJOP）、ATP合酶以及细胞质/周质氢化酶的下调表明质子梯度的崩溃。这些发现对控制SRB生长、防止硫酸盐还原引起的腐蚀和污染提供了新的思路和方法，也对提高工业运营的经济效益具有重要意义。

06、湖泊生态恢复区复促进微生物碳泵增强水生碳固存

题目:Macrophyte Restoration Promotes Lake Microbial Carbon Pump to Enhance Aquatic Carbon Sequestration

发表期刊:Global Change Biology

影响因子:10.8

作者单位:中国科学院大学

涉及的凌恩生物服务产品:二代16S扩增子

主要研究内容

本研究通过16S rRNA基因测序方法，对湖泊生态恢复区与未恢复区的微生物群落组成与多样性进行了深入分析。结果显示，恢复区不仅显著改善了水质、减轻了富营养化现象，还通过促进关键微生物种群的增殖，增强了微生物碳泵功能。这些微生物在高溶解氧环境下表现出更高的活性，促进了甲烷的氧化，从而降低了甲烷排放。同时，它们还刺激了腐殖质溶解性有机碳（RDOM）的形成，有助于长期碳储存。相比之下，未恢复区则呈现出微生物群落同质化、更多活跃藻类衍生的DOM及较低稳定性的碳保留等特点。这些发现强调了水生大型植物恢复的额外功能，为未来旨在促进可持续水生生态系统和缓解全球变暖的恢复工作提供了宝贵的见解。

07、植物残体微生物分解过程中真菌与细菌的相互作用

题目:A novel decomposer-exploiter interaction framework of plant residue microbial decomposition

发表期刊:Genome Biology

影响因子:10.1

作者单位:南京农业大学

涉及的凌恩生物服务产品:二代16S扩增子+二代ITS扩增子+宏转录组

主要研究内容

本研究采用多组学方法，分析植物残体微生物分解过程中真菌与细菌的相互作用及其机制。结果表明，随着残留物复杂性的增加，真菌表现出更高的适应性，而细菌的丰富度急剧下降。真菌和细菌的不同功能进化是由残留物复杂性驱动的，但遵循不同的轨迹。从根本上说，真菌进化为促进植物残留物降解，因此始终是占主导地位的分解者。相反，细菌主要增加糖苷酶基因的表达以利用真菌降解产物，从而始终充当利用者。真菌的存在使细菌能够并经受住细菌的利用。本研究引入了植物残留微生物分解过程中真菌分解者和细菌利用者的新框架，促进了我们对控制有机碳循环的微生物过程的全面理解，还为农业废弃物处理和资源循环利用提供了新的策略和思路。

08、盐胁迫下杨树根际微生物群落组装机制研究

题目:Assembly, network and functional compensation of specialists and generalists in poplar rhizosphere under salt stress

发表期刊:npj Biofilms and Microbiomes

影响因子:7.8

作者单位:北京林业大学

涉及的凌恩生物服务产品:二代16S扩增子+二代ITS扩增子

主要研究内容

本研究通过16S rRNA基因扩增子测序方法，探讨不同盐度梯度下胡杨根际土壤微生物群落的组装机制。结果表明，随着盐度的变化，微生物群落中的泛化种和专化种展现出了不同的适应策略。泛化种具有更广泛的环境适应性，而专化种则对特定环境条件更为敏感。此外，研究还发现盐度是影响微生物群落结构和功能的关键因素之一，它通过改变微生物之间的相互作用和竞争关系，进而影响了微生物群落的稳定性和功能多样性。这些发现对于理解盐渍化环境下微生物群落的动态变化以及开发微生物改良策略具有重要意义。

二月客户文章列表

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