聚类可视化之前使用pca报错:TypeError: PCA does not support sparse input. See TruncatedSVD for a possible alterna

PCA 报NaN问题 没有效果,那是不是存在一些inf,数据预处理没做好的问题?经过报错看,不是其他问题,还是nan的问题。虽然开头删过NaN代码生成过程中是不是又产生了None,再删一次。定位问题:数据中存在NaN值,给他删除掉。 阅读详情

意思是,PCA不接受稀疏矩阵?

有办法将稀疏矩阵传入PCA么?——试着转为数组形式(toarray)
如不行,那应该如何操作?——使用SVD(scikit-learn中有)

参考代码:

from sklearn.feature_extraction.text import TfidfVectorizer
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.decomposition import TruncatedSVD
from sklearn.preprocessing import Normalizer
from sklearn.pipeline import make_pipeline


documents = ["Beautiful is better than ugly.",
"Explicit is better than implicit.",
"Simple is better than complex.",
"Complex is better than complicated.",
"Flat is better than nested.",
"Sparse is better than dense.",
"Readability counts.",
"Special cases aren't special enough to break the rules.",
"Although practicality beats purity.",
"Errors should never pass silently.",
"Unless explicitly silenced.",
"In the face of ambiguity, refuse the temptation to guess.",
"There should be one-- and preferably only one --obvious way to do it.",
"Although that way may not be obvious at first unless you're Dutch.",
"Now is better than never.",
"Although never is often better than *right* now.",
"If the implementation is hard to explain, it's a bad idea.",
"If the implementation is easy to explain, it may be a good idea.",
"Namespaces are one honking great idea -- let's do more of those!"] 


tfidf_vectorizer = TfidfVectorizer(max_features=1000, stop_words='english', use_idf=True)
X = tfidf_vectorizer.fit_transform(documents)

svd = TruncatedSVD(10)
normalizer = Normalizer(copy=False)
lsa = make_pipeline(svd, normalizer) 
Xnew = lsa.fit_transform(X)

model = KMeans(n_clusters=3, init='k-means++', max_iter=100, n_init=1, verbose=False)
model.fit(Xnew)

PCA学习过程遇到的问题 PCA学习过程遇到的问题 目录 1、遇到的问题。 2、解决方法。 1、遇到的问题。 在学习PCA时遇到这个公式 S是样本协方差矩阵,于是打算用代码测试一下。 数据如下 X=np.array([[1 ,5 ,6] ,[4 ,3 ,9 ],[ 4 ,2 ,9],[ 4 ,7 ,2]]) 样本的协方差矩阵S用np求出。 x2 = np.cov(X.T) print(x2) 得出如下结果 [[ 2.25... 阅读详情

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