GeoS v2.3分割CT数据

本文仅对如何使用GeoS做简单的CT图像分割做介绍，适合初学者在处理大量实验数据时用，欢迎专业分割领域的大神指正。

GeoS由微软研究院开发，是一款对医学图像进行交互性的半自动分割的工具。

1、开始界面

2、点击LoadVolume，可以加载要进行处理的CT数据，也可以将数据直接点击鼠标左键进行拖拽到用户界面，如下图：

所选中的三个红色方框，可以进行基础的分割设置，包括画刷的粗细（brush opacity）、显色深浅（brush size）、分割部分显色深浅（segment opacity），分割label设置。通过调节（Window）、（level）可以随时变化CT图像由黑到白的显色情况，调节到较为清晰的状态一遍进行分割。软件进行分割操作的基本操作是：按住shift+鼠标左键表示选中该部分，并且目标为所要分割的部分；按住shift+鼠标右键表示选中该部分，并且表示选中部分计算的时候不应该被保留。然后可以进行计算操作。

3、导出与导入

可以将画完的CT保存到文件夹即为导出，包括brush与segment

也可以将之前画的brush导入到GeoS界面进行二次修改

通过compute或者直接按F5即可不断计算，得到所要分割的部分。分割部分保存为分割目标的二值图像形式。

本人非专业的图像分割领域人员，仅仅用到了该工具做数据处理，上手快，节约时间，关于Geos还有很多需要补充的功能介绍，欢

迎大家批评指正！