百度推出LinearDesign，全球首个mRNA疫苗不稳定性解决方案，仅需16分钟

十三 发自 凹非寺 
量子位 报道 | 公众号 QbitAI

新冠疫情全球流行，疫苗研制成为当务之急。

mRNA作为一种全新的疫苗类型，能够快速大规模生产， 因此成为科学家们攻克的主阵地之一。

新冠疫情爆发后，RNA设计领域世界知名专家、斯坦福大学生物化学系Rhiju Das教授关注到疫苗研发存在的一个非常棘手的问题：

找到一个既具有稳定二级结构，而且还有效的mRNA疫苗。

有多难？

首先是稳定性，mRNA疫苗“脆弱”到在保存、运输过程中，就有可能因为降解而失效。

然后是有效性，需要找一个mRNA序列，能够翻译成特定的蛋白质(抗原)。

单是满足这两个条件，若是采用遍历的方式去寻找，那就需要查看10⁶³²个mRNA序列！

这是什么概念？用一台超级计算机来处理，即便一秒钟能计算一个新冠RNA序列的二级结构，哪怕是从宇宙诞生到现在(130-140亿年)，连“潜在”mRNA序列的亿万分之一都没算到。

仅靠科研人员的力量是远远不够的，那就“全民参赛”吧！

于是乎，Rhiju Das教授便找到了百度，使用百度此前开源的LinearFold算法，搭建一个疫苗设计公开赛，让全民参与进来，以游戏的形式，边玩边找这个mRNA。

但正如刚才提到的，搜索空间是异常庞大，难道就没有办法在相对节省人力的情况下，就能够设计出满足条件的mRNA疫苗序列呢？

这个可以有。

现在，(可能)“拯救世界”的新算法，LinearDesign，来了！

LinearDesign：最快16分钟完成mRNA疫苗序列设计

其实，回顾近二十年的历史，随着全球化和城市化的深入发展，全球疫情爆发周期越来越短——从2002年的SARS，到2012的MERS，再到现如今的新冠病毒。

面对一次又一次的冠状病毒的侵袭，快速研制出特定疫苗成为了解决问题的一种途径。

那么，在mRNA疫苗如此庞大的搜索空间面前，LinearDesign又能起到什么作用？