医图论文 Arxiv‘24 | 基于U形结构和注意力机制的轻量级卷积医学目标分割网络

分割方向论文精读:从FCN到Transformer的技术脉络与实战方法 图像分割是计算机视觉的核心任务,涵盖语义分割、实例分割、点云分割等方向。从FCN开创全卷积网络,到U-Net引入跳跃连接,再到DeepLab利用空洞卷积扩大感受野,以及Transformer通过自注意力建模全局依赖,分割技术经历了从局部到全局、从粗糙到精细的演进。这些技术价值在于实现像素级理解,广泛应用于自动驾驶、医学影像分析、机器人导航等场景。本文系统梳理了分割论文精读的通用方法论,包括网络结构分析、损失函数理解、评估指标解读和实验复现技巧,帮助研究者高效掌握技术脉络,避免陷入论文海洋。 阅读详情

论文信息

题目:A lightweight Convolutional Neural Network based on U shape structure and Attention Mechanism for Anterior Mediastinum Segmentation
基于U形结构和注意力机制的轻量级卷积神经网络用于前纵隔分割

论文创新点

  1. 作者提出了一个基于U形结构网络的前纵隔(AM)分割模型,该模型专门设计用于自动检测胸部CT扫描中的前纵隔病变(AMLs)。

  2. 为了在保持轻量级网络的同时利用多头自注意力(MHSA)的优势,作者设计了一个并行MHSA,称为Wide-MHSA (W-MHSA)。这种设计通过将输入特征图分成更小的块,并行处理,显著减少了网络中的参数数量。

  3. 作者引入了**Channel Depth-Wise Cross-Correlation Attention (CD-WCC)**在编码器中寻找编码器和解码器之间的相似性,以改善器官定位。

  4. 为了保持长距离依赖并避免在上采样阶段丢失关键信息,作者设计了Dilated Depth-Wise Parallel Path connection (DDWPP)。这种连接通过使用不同扩张率的扩张卷积,增强了模型的感受野,同时保持了特征图的空间精度。

摘要

为了自动检测前纵隔(Anterior Mediastinum, AM)中的前纵隔病变(Anterior Mediastinum Lesions, AMLs),首先需要一个专门为AM设计的自动分割模型。由于AML的发生率极低,使得进行类似肺癌筛查的研究变得具有挑战性。回顾性审查一段时间内的胸部CT扫描以调查AML的发生率需要大量的时间。因此,开发一个人工智能(AI)模型来帮助定位AM对于放射科医生提高工作量管理和AMLs的诊断准确性具有重要意义。在本文中,作者介绍了一个U形结构网络来分割AM。使用了两种注意力机制来保持长距离依赖和定位。为了结合多头自注意力(Multi-Head Self-Attention, MHSA)的潜力和轻量级网络,作者设计了一个并行MHSA,称为Wide-MHSA(W-MHSA)。保持长距离依赖对于上采样特征图时的分割至关重要。因此,作者为此目的设计了一个扩张的深度卷积并行路径连接(Dilated DepthWise Parallel Path connection, DDWPP)。为了设计轻量级架构,作者引入了一个扩展卷积块,并将其与提出的W-MHSA结合用于编码器部分的特征提取。提出的网络在2775个AM病例上进行了训练,获得了平均Dice相似系数(DSC)为87.83%,平均交并比(IoU)为79.16%,敏感性为89.60%。作者提出的架构与最先进的分割网络(如Trans Unet, Attention Unet, Res Unet和Res Unet++)相比,展现出了优越的分割性能。

关键字

前纵隔(AM),自注意力,交叉相关注意力,U形结构。

III. 提出的网络架构

所提出的架构如图1所示,设计为U形结构,包括三个组成部分:编码器、解码器和编码器与解码器之间的并行路径连接。

编码器提取特征图,并将输入维度从3×224×224减少到512×7×7。解码器相对于输入尺寸提高特征图的维度。编码器和解码器都被设计为五个连续的阶段。此外,作者采用了两种高效注意力方法,以显著增强每个解码器和编码器块中的器官分割恢复,增强了模型的能力。在解码器提高高度和宽度后,通道注意力应用于通道维度。作者不使用高度和宽度上的平均值和最大值进行通道注意力,而是利用深度交叉相关[34]来寻找编码器和解码器每个阶段之间的相似特征图。接下来,相似性的有效性乘以特征图。并行路径连接设计为五个扩张卷积,具有不同的过滤器尺寸和扩张率。扩张卷积提供了增强的感受野大小,并在不增加参数数量的情况下检索多个尺度的特征。

A. 扩展卷积块

在特征提取部分,作者扩展了卷积层,并在五个阶段构建了所提出的特征提取,如图2所示。

此外,作者使用1×1卷积作为主要部分,而不是3×3卷积。每个步骤的输入通道被分成更小的块,然后为每个较小的通道独立应用单独的卷积滤波器。为了为下一阶段做好准备,所有通道的特定特征在通道维度上进行连接,然后通过一个3×3卷积层。输入图像尺寸为3×224×224。

  • 在阶段0,根据输入通道,三个不同的1×1卷积层独立应用。连接后,一个3×3卷积层将通道提高到64,高度和宽度减少到112。

  • 在阶段1,64个通道被分成2。两个32×112×112同时通过1×1卷积层,并在通道维度上连接回到64个通道,然后得到的特征提取器尺寸为128×56×56。

  • 阶段2的结构与阶段1相同。然而,输出尺寸的通道、高度和宽度维度分别为128、28和28。

  • 阶段3被设计为比其他阶段更深更广,以捕获更复杂的特征和模式,因为输入数据通过网络的进展。尽管它保持了与前几个阶段相同的结构,但它涉及四个1×1卷积同时进行,连接,以及一个额外的3×3卷积。最后,阶段3的特征提取结果为256×14×14。

  • 设计策略与前一阶段相同。然而,输入通道大小为256,除以2。因此,两个64×14×14进入两个1×1卷积独立进行。连接后,输出尺寸为512×7×7,通过一个3×3卷积。

B. 宽多头自注意力(W-MHSA)

注意力机制可能因输入维度而成为重量级,因为由于全连接层。在这项研究中,特征图的高度和宽度被分成小块,以克服自注意力的重量级。在所提出的网络的编码器中使用了三个不同的MHSA。图3(a)中显示的四个并行MHSAs,图3(b)中显示的两个并行MHSAs,以及图3©中显示的一个MHSA分别用于阶段1和2、阶段3和阶段4。并行MHSAs在这项研究中被命名为Wide-MHSA(W-MHSA)。

在这里插入图片描述

  • 通过阶段1后,输出为64×56×56。首先,在阶段1后应用W-MHSA(宽度比率为4)。W-MHSA(宽度比率为4)设计为四个分支。因此,W-MHSA(宽度比率为4)的输入在高度和宽度上被分成4。首先,四个64×14×14进入四个不同的MHSA。其次,四个MHSA的输出在高度和宽度维度上连接。这些连接的输出再次在高度和权重上连接,然后两个连接阶段相乘。最后,它通过一个卷积层。

  • 此外,对于阶段2,输入128×28×28被4分割。随后,四个128×7×7进入四个单独的MHSAs,方法与阶段1类似。

  • 完成阶段3后,输入尺寸为256×14×14。步骤与前几个阶段相同,不同的是宽度和高度被分成两个。2×(256×7×7)通过两个并行MHSAs(W-MHSA(宽度比率为2))。高度和宽度从两个MHSA输出中连接,然后这两个连接再次在高度和宽度维度上连接。最后,最后两个连接相乘,并通过卷积层。

  • 此外,对于阶段4之后,输入尺寸为512×7×7,使用了单个MHSA。作者在图3中提供了W-MHSA的更多细节,其中(a)将输入尺寸分成4,(b)分成2,©是原始MHSA。

C. 通道深度智能交叉相关注意力(CDWCC)

交叉相关模块是一个计算过程,它将两组特征图进行卷积。它通常用于SiamRPN++[34]等技术中的跟踪目的。这个模块的工作机制类似于两组不同的特征图。这项研究使用交叉相关来寻找编码器和解码器之间的相似性。相关过程在两个具有相同数量的通道、高度和宽度的不同特征图上逐通道进行。根据图4,解码器的特征图是CDWCC的输入,而编码器的特征图是执行相关操作的内核,逐通道寻找相似性。最后,CDWCC特征图与解码器特征图逐元素相乘。

D. 扩张深度智能并行路径连接(DDWPP)

为了拥有高视野,设计了DDWPP。如图5所示,它有五个并行扩张卷积,具有不同的内核尺寸和扩张率,可以在不增加参数数量的情况下捕获大的感受野。在分割过程中,下采样特征图可能会丢弃关键组件。因此,保留编码器的初始阶段的信息对于随后的上采样阶段至关重要。有效地拥有每个阶段的特征图有助于作者提出的网络避免丢失信息。此外,初级阶段具有低级信息,而最后阶段具有宝贵的信息。如图5所示,扩张卷积技术在保持特征图的空间精度的同时扩大了感受野。作者在DDWPP块中使用了四个并行扩张卷积,以增加对小AM的检测灵敏度。这四个扩张卷积分别遵循16、8、4和2的扩张率,以及7×7、5×5、5×5和3×3的过滤器尺寸。

IV. 材料和实验


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  • 求解器 & 损失函数简介
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  • Transformer结构简介
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