Linux系统下装R包又慢又容易报错?

短话短说:Linux安装默认从源码安装,因此在终端中使用R console装包时会从源码重新编译,这个过程十分耗时,且很容易出错。解决方案有二:1)使用 Rstudio / Rstudio-server,因为Rstudio支持预编译安装,直接下载安装编译好的R包,省时省力;2)使用包管理工具,如conda,通过 conda install 直接安装R包的预编译版本

短话长说版本
打开Linux终端、键入R进入R console、install.packages(…),然后字符便开始在屏幕上发了疯似地滚动。看着酷炫的输出,你心中不禁暗爽:“啊,Linux的浪漫,电影里拍的黑客场景也不过如此!🦹”。然后,经过久到你怀疑人生的等待,久到你开始感慨还是图形界面简单的时候,寂静终究被一道鲜红刺眼的 Error 划破,给你那早已脆弱不堪的心灵来了一记小小的Linux震撼🤯🤯🤯 … …

最近由于科研的需要,要用到一些 R 语言包,当我尝试在服务器上安装需要的包时,就出现了我上面所描述的情景。之前用Python的包管理工具 pip 装Pyhton包时明明可以很快的,同样是用的国内的镜像站,可是为什么安装R包时却这么慢?

为了查明原因,我又在服务器上的Rstudio-server上用同样的命令安装了一下,不同的是,这次的安装十分迅速,而且console也没有被各种打印的Log信息填满。

经过到stackoverflow等技术网站查询,找到了问题的关键:
在这里插入图片描述
简单地说,就是Linux中在R console里通过 install.packages 安装R包的时候,会重新编译一遍源码,这个过程十分耗时,而且容易出错。可是为什么在Rstudio-server里安装不会这样呢?因为Rstudio提供了安装预编译版本的支持,不许在安装的时候,在本地重新编译。常用的包管理工具,比如 conda,同样支持安装预编译好的R包。

### Linux 上 Tomcat 部署 WAR 文件时常见错误解决方案 当在 Linux 系统上部署 WAR 文件至 Tomcat 服务器时,可能会遇到多种类型的错误。以下是针对一些常见的部署问题及其解决方法: #### 错误一:无法访问应用 如果将 `Jenkins.war` 复制到 Apache Tomcat 的 "webapps" 文件夹之后仍然无法通过浏览器访问应用程序,则可能是由于 Tomcat 尚未重新启动[^1]。 为了使新的 WAR 文件生效并能够正常工作,在完成文件复制操作后应当重启 Tomcat 服务。可以通过执行如下命令来停止再启动 Tomcat: ```bash cd $CATALINA_HOME/bin ./shutdown.sh ./startup.sh; tail -f ../logs/catalina.out ``` 这组指令会先关闭正在运行的服务实例,随后再次开启它,并实时查看日志输出以便监控启动过程中的任何异常情况[^2]。 #### 错误二:连接超时或拒绝连接 此类问题是网络配置不当引起的可能性较大。确认防火墙设置允许外部请求到达指定端口(默认情况下为8080),并且确保 SELinux 或其他安全模块不会阻止 HTTP 请求被处理。 另外还需检查是否有多个进程试图监听同一端口号造成冲突;可以利用 netstat 工具排查此状况。 #### 错误三:缺少依赖库或插件不兼容 有时即使成功上传了 WAR 也可能因为缺失必要的 Java 库或是版本差异而导致加载失败。对于这种情况建议仔细阅读 catalina.log 中记录的具体报错信息,针对性地调整项目结构或者升级/降级相关组件直至匹配为止。 例如,若需集成 Apache HTTP Server 和 Tomcat 可能需要用到 mod_jk 连接器,此时应确保已正确放置对应的 `.so` 动态链接库文件于适当位置,比如 `/usr/lib/apache/modules/` 下面[^3]。 ---
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