计算化学软件套件CHARMM在KeyarchOS系统上安装教程

1 概述

浪潮信息KOS是浪潮信息基于Linux Kernel、OpenAnolis等开源技术自主研发的一款服务器操作系统，支持x86、ARM等主流架构处理器，性能和稳定性居于行业领先地位，具备成熟的 CentOS 迁移和替换能力，可满足云计算、大数据、分布式存储、人工智能、边缘计算等应用场景需求。详细介绍见官网链接浪潮信息云峦服务器操作系统KeyarchOS_KOS服务器操作系统-浪潮信息

CHARMM（Chemistry at HARvard Macromolecular Mechanics）是一款强大的计算化学软件套件，主要用于分子动力学模拟和生物分子结构分析。由哈佛大学的Martin Karplus等人于1984年首次开发，CHARMM在计算生物大分子（如蛋白质和核酸）的结构、动力学和相互作用方面发挥了关键作用。其中一个显著的特点是其用于模拟原子和分子相互作用的分子动力学模拟功能，这有助于深入理解生物大分子的结构和功能。CHARMM还提供了用于构建和优化生物分子结构、进行能量计算和优化、采用不同溶剂模型模拟溶液中分子行为的工具。通过支持并行计算，CHARMM能够在多核或分布式计算环境中执行大规模的模拟。其灵活性体现在用户可以根据需要定义新的分子力场参数，以适应不同的研究需求。总体而言，CHARMM在计算化学和生物物理学领域的研究中发挥着关键作用，提供了全面而灵活的工具来深入了解分子的行为。详细介绍见官网链接CHARMM: Home

2 安装环境

2.1 操作系统环境

版本信息：KeyarchOS 5.9

硬件平台：X86_64

2.2 工具版本

CHARMM- Free Version 46b2

https://pan.baidu.com/s/1RO6GTS8ckBL9wXPmte8zSA?pwd=cbbq

3 安装与测试

3.1 安装CHARMM

在https://pan.baidu.com/s/1RO6GTS8ckBL9wXPmte8zSA?pwd=cbbq

下载charmm安装包

将下载文件上传到服务器,解压。

 进入charmm

安装前先装cmke gcc-gfortran

执行./configure

cd /build/cmake，make编译

编译完成

make install 安装

export PATH=/root/test/charmm/bin:$PATH将 CHARMM 可执行文件的路径添加到 PATH

安装完成

3.2 测试

执行charmm，进入交互界面

可以看到charmm版本CHARMM- Free Version 46b2

执行read sequ pdb sele all end

 执行stop退出

上述表明安装成功。