Gaussian09在KeyarchOS 5.9下的安装过程

量化计算 Gaussian 09 默认为短信通知,可在平台左侧菜单栏【设置】->【消息提醒】->【计算】处设置其他通知方式。例如,ECD/UV计算需要选择激发态数目,默认为30个。激发态数目越多,ECD/UV图谱覆盖的波长范围越广(从长波长到短波长),同时,计算量(时间)也越大。因此,上传的分子结构须具有同一性质,不同性质(如,电荷)的分子结构应分别建立任务进行计算。功能入口:平台左侧菜单栏【计算方案】->【大方案】->【量化计算】->【量化计算(Gaussian 09)】点击【提交】,选择支付方式,点击【确认】,提交任务。 阅读详情

1 概述

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Gaussian 09 是一个强大的计算化学软件包,用于计算量子化学性质、分子结构、反应动力学等。它由 Gaussian, Inc. 公司开发,被广泛用于科研领域,尤其是计算化学和理论化学的研究中。Gaussian 09 提供了一系列先进的量子化学计算方法,包括从密度泛函理论(DFT)到各种级别的分子轨道理论。详细介绍见官网链接www.gaussian.com。

2 安装环境

2.1 操作系统环境

版本信息:KeyarchOS 5.9

硬件平台:X86_64

2.2 工具版本

Gaussian 09

百度网盘 请输入提取码 提取码:s028

3 安装与测试

3.1 Gaussian09安装

在百度网盘 请输入提取码 提取码:s028

下载安装包

上传到服务器,解压

cd g09 新建tmp文件夹 mkdir tmp

配置变量 vi /etc/profile

新增

export g09root=/root/test/g09/(解压路径)

export GAUSS_EXEDIR=$g09root/g09

export GAUSS_SCRDIR=$g09root/tmp

export PATH=$PATH:$g09root/g09

 执行source /etc/profile

执行echo $g09root验证

执行export PATH=/root/test/g09/:$PATH

执行export GAUSS_EXEDIR=/root/test/g09/

然后在g09目录下再次执行chmod 750 -R * ,Gaussian如果发现其可执行文件对于所有用户都可以访问时就不能运行

 安装完成

3.2 测试

新建一个test目录

进入test文件夹,执行一个简单的测试计算

创建一个创建一个文本文件,命名为 test9.com,并在其中输入以下测试计算的输入:

%chk=opt.chk

%nprocshared=4

%mem=1GB

# HF/6-31G(d) Opt


Molecule Optimization


1 1

H 0.0 0.0 0.0

O 0.0 0.0 1.0


~

然后执行g09 test.com 开始计算,完成后查看生成的test9.log

 

上述表明安装成功

量子化学软件:Gaussian二次开发_(1).Gaussian二次开发基础 通过二次开发,用户可以大大提高 Gaussian 的使用效率和灵活性。Python、Perl 和 Bash 脚本都是实现二次开发的有效工具。它们可以帮助用户自动化生成输入文件、提交计算任务和解析输出文件,从而节省大量时间和精力。此外,通过编写自定义脚本,用户还可以实现更复杂的计算流程和数据分析,进一步提升研究工作的质量和效率。希望本文档对您在 Gaussian 二次开发方面的学习和实践有所帮助。如果您有任何问题或需要进一步的帮助,请随时联系。 阅读详情

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