基本信息
1. 标题:Integrated diffusion image operator (iDIO): A pipeline for automated configuration and processing of diffusion MRI data
2. 期刊:Human Brain Mapping
3. IF/JCR/分区:5.399/Q1/中科院二区
4. DOI:10.1002/hbm.26239
目录
1、导读
2、软件开发背景
3、软件介绍
3.1 iDIO 工作流
3.2 iDIO QC报告
3.3测试数据
4、软件测试结果
4.1 iDIO生成的数据
4.2 运行时间
4.3 数据QC和信噪比
5、结论
1. 导读:
扩散磁共振成像( diffusion magnetic resonance imaging,dMRI )数据的预处理涉及多个步骤,包括头动校正、磁化率失真、低信噪比和信号漂移等。研究者往往需要根据不同的图像采集方案配置不同的预处理步骤,这增加了dMRI分析的技术门槛。这可能导致数据处理方法的差异,从而阻碍研究之间的可比性。为了使dMRI数据处理步骤透明化,适应各种dMRI采集方案,我们提出了一种半自动化的dMRI工具,即iDIO。该流程整合了dMRI软件工具和目标的特性,通过根据输入数据自适应配置一组建议的处理步骤,为dMRI数据分析提供一键式解决方案。此外

iDIO是一个半自动化工具,旨在简化扩散磁共振成像(dMRI)数据的预处理,提供标准化处理流程。它整合了ANTs、FSL、MRtrix3和Prquality的功能,能根据输入数据自适应配置处理步骤,并生成质量控制报告。iDIO适用于多种临床MRI供应商的数据,减少了dMRI处理的技术门槛和不一致性。
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