使用Python删除具有某些特征的几行数据

本文介绍了一个使用Python编写的脚本,该脚本利用CD-HIT工具进行数据整理,通过设置100%的相似度阈值来去除数据集中的冗余序列,仅保留完全相同的簇。具体实现过程包括读取原始文件、筛选满足条件的簇并将其写入新的文件中。
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进行数据整理时所写的脚本,使用CD-HIT去冗余,设置阈值为100%,将有多条的簇留下来。
cd1.txt:

在这里插入图片描述
从上图中找出找出100%的簇,放到cd2.txt中

cd2.txt

在这里插入图片描述

with open('cd1.txt', 'r') as f:
    lines = f.readlines()#按行读取文件
with open('cd2.txt', 'w') as f_w:
    for i in range(len(lines)):
        if(lines[i][0] == '0' and lines[i+1][0]=='1'):#将有100%的簇写入到cd2.txt文件中
            f_w.write(lines[i - 1])
            print(i, "***", lines[i - 1])
            f_w.write(lines[i])
            print(i, "***", lines[i])
            f_w.write(lines[i + 1])
            print(i, "***", lines[i + 1])
            i = i + 2
            while(lines[i][0] != '>'):
                f_w.write(lines[i])
                print(i, "***", lines[i])
                i = i + 1
            continue
        else:
            i = i + 1

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<think>好的,我现在需要解决用户的问题:用Python pandas读取CSV文件的最后几行数据删除相关内容。首先,我需要回忆一下pandas读取CSV文件的相关方法,尤其是如何读取文件的末尾部分。 用户提到想读取最后几行删除相关内容。根据我之前了解的pandas函数,通常使用read_csv时,可以通过参数来控制读取的行数。比如nrows参数可以指定读取前几行,但用户需要的是最后几行,这可能需要其他方法。 参考引用里的资料,特别是引用[2]提到,可以使用nrows结合skiprows来读取最后N行。具体来说,可以先确定文件的总行数,然后跳过前面的行数,只读最后的N行。比如,如果文件有100行,要读取最后5行,可以设置skiprows=95(因为从第96行开始读取,但需要考虑header的情况)。不过,这种方法需要先确定总行数,可能需要先读取整个文件,这样对于大文件可能效率不高。 另一种方法是使用尾部的函数,比如在Linux中用tail命令,但用户希望用pandas实现。可能需要在Python中先获取文件的总行数。可以用csv模块来快速计算行数,然后计算需要跳过的行数,再用pandas读取。 接下来是删除指定内容的步骤。读取最后几行后,可能需要从原文件中删除这些行。或者,用户可能希望读取这些行,确认后删除,然后保存文件。这里需要考虑如何定位这些行并删除。 可能的步骤是: 1. 使用pandas读取CSV文件的最后N行。 2. 根据这些行的内容进行判断,确定需要删除的行。 3. 从原始数据删除这些行,并保存修改后的数据CSV文件。 具体实现时,读取最后几行可以通过以下方法: - 使用pandas的read_csv,结合skiprows参数,跳过前面的行数。比如,总行数减去N行,得到需要跳过的行数。但需要注意header的处理,如果CSV有标题行,可能需要调整。 例如,假设文件有标题行,总行数为M(包括标题),要读取最后N行数据,则skiprows应为1到M-N之间的行数。因为标题行是第一行,所以数据行是M-1行。要读最后N行数据,需要跳过前面的(M-1 - N)行数据,加上标题行,所以skiprows=range(1, M - N)。不过这可能有点复杂,需要准确计算行数。 另一种方法是用csv模块先获取总行数,再处理。比如: import csv with open('file.csv', 'r') as f: reader = csv.reader(f) row_count = sum(1 for row in reader) 然后,如果标题存在,数据行数是row_count -1。假设要读取最后5行数据,则skiprows的范围是1到(row_count -1 -5),然后nrows=5。这可能需要调整参数。 或者,使用pandas的tail方法,直接读取整个文件然后取最后几行。但这样对于大文件可能不够高效,因为需要读取整个文件到内存。如果文件很大,这可能不可行,但用户可能处理的文件不是特别大,所以这个方法也是可行的。 所以,步骤可能是: 1. 读取整个文件到DataFrame。 2. 使用.tail(N)获取最后N行。 3. 根据条件筛选需要删除的行,得到要删除的索引。 4. 在原DataFrame中删除这些索引。 5. 保存回CSV文件。 但用户可能希望不读取整个文件,尤其是当文件很大时。因此需要更高效的方法。这时候可能需要分两步:先确定最后N行的位置,然后删除这些行,或者修改原文件。 不过,根据引用[2],Efficiently Read last 'n' rows of CSV into DataFrame的答案中,接受的方法是使用csv模块找到最后的位置,然后用pandas读取。这可能比较复杂。 如果用户更关心代码简洁性而不是内存,可能直接读取整个文件,处理后再保存。例如: import pandas as pd # 读取整个CSV文件 df = pd.read_csv('file.csv') # 获取最后5行 last_rows = df.tail(5) # 假设需要根据某些条件删除这些行 # 例如,删除最后5行 df = df.drop(last_rows.index) # 保存修改后的数据 df.to_csv('file.csv', index=False) 但这样会覆盖原文件,删除最后5行。但用户可能想根据内容删除,而不仅仅是最后几行。所以可能需要先读取最后几行,检查它们是否符合删除条件,再在原数据删除对应的行。 例如,假设用户想读取最后5行,然后删除其中满足某个条件的行: # 读取整个文件 df = pd.read_csv('file.csv') # 获取最后5行 last_rows = df.tail(5) # 找出需要删除的行(例如,某列值为特定值) to_delete = last_rows[last_rows['column'] == 'value'] # 从原DataFrame中删除这些行 df = df.drop(to_delete.index) # 保存 df.to_csv('file.csv', index=False) 但问题在于,如果用户不想读取整个文件,可能需要更高效的方法。但通常对于中等大小的文件,直接读取整个文件是可行的。如果文件很大,可能需要逐块读取,但处理起来比较复杂。 总结用户的可能需求: 1. 读取CSV的最后N行。 2. 根据内容删除这些行(或其中的某些行)。 3. 保存修改后的文件。 因此,解决方案可以是: - 使用pandas读取整个文件,处理最后几行,再保存。 - 或者,如果文件很大,采用逐行读取的方式,但用pandas可能不太方便,需要结合其他方法。 根据引用[3]和[4],pandas可以通过指定行或列来读取数据。例如,使用skiprows和nrows参数组合来读取中间或末尾的行。这可能更高效。 所以,正确的步骤可能是: 1. 确定CSV文件的总行数(包括标题)。 2. 计算需要跳过的行数:总行数 - N -1(如果有标题行)。 3. 使用pd.read_csv('file.csv', skiprows=skip_rows, header=None)来读取最后N行,可能需要处理列名。 4. 然后,确定需要删除这些行的索引,并从原数据删除。 不过,这里可能需要两次读取:一次读取最后几行,另一次读取整个文件。或者,如果使用两次读取,可能效率不高。因此,如果文件不是特别大,直接读取整个文件可能更简单。 例如,代码示例: import pandas as pd # 读取整个CSV文件 df = pd.read_csv('file.csv') # 获取最后5行 last_5 = df.tail(5) # 假设要删除最后5行,可以直接切片 df = df.iloc[:-5] # 或者根据条件删除 # 例如,删除最后5行中某列满足条件的行 mask = df.tail(5)['column'] == 'value' indices_to_delete = df.tail(5)[mask].index df = df.drop(indices_to_delete) # 保存修改后的文件 df.to_csv('file.csv', index=False) 但用户可能希望不读取整个文件。例如,当文件很大时,读取整个文件可能消耗内存。这时需要其他方法。 引用[2]中提到的方法可能更高效:使用csv模块找到最后N行的位置,然后用pandas读取。例如: import csv import pandas as pd filename = 'file.csv' # 计算总行数 with open(filename, 'r') as f: reader = csv.reader(f) row_count = sum(1 for row in reader) # 要读取最后N行,假设有标题行 N = 5 skip_rows = row_count - N - 1 # 总行数减去N行数据再减标题行 # 读取最后N行,header=None需要处理列名 df_tail = pd.read_csv(filename, skiprows=range(1, skip_rows + 1), header=0) # 这里header=0表示第一行为列名,skiprows跳过前面的数据行 然后,处理df_tail中的行,确定需要删除的内容,再从原文件中删除。但如何删除原文件中的这些行呢? 可能需要重新读取整个文件,然后根据索引删除。或者,如果知道这些行在文件中的位置(最后N行),可以直接在保存时排除这些行。例如,读取整个文件时排除最后N行: df = pd.read_csv(filename) df = df.iloc[:-N] df.to_csv(filename, index=False) 但这样直接删除了最后N行,而不需要检查内容。如果用户需要根据内容删除最后几行中的某些行,可能需要更复杂的步骤。 综上,用户的请求可能分为两种情况: 1. 删除CSV文件的最后N行。 2. 读取最后N行,根据内容删除符合条件的行。 如果是第一种情况,直接切片即可。如果是第二种情况,需要先读取最后N行,判断后再删除。 因此,完整的步骤可能如下: 情况一:删除最后N行 import pandas as pd # 读取整个文件 df = pd.read_csv('file.csv') # 删除最后N行 df = df.iloc[:-N] # 保存 df.to_csv('file.csv', index=False) 情况二:读取最后N行,根据条件删除其中某些行 import pandas as pd # 读取整个文件 df = pd.read_csv('file.csv') # 获取最后N行 last_n = df.tail(N) # 确定需要删除的行的索引 to_delete = last_n[last_n['column'] == 'value'].index # 从原数据删除这些索引 df = df.drop(to_delete) # 保存 df.to_csv('file.csv', index=False) 如果用户希望避免读取整个文件,可以采用更高效的方法,比如使用csv模块确定行数,然后只处理需要的部分,但代码会更复杂。 总结:使用pandas的tail方法读取最后几行,处理后再保存整个文件是最直接的方法。虽然可能对大文件不够高效,但对于一般情况已经足够。</think>要使用Python pandas读取CSV文件的最后几行删除指定内容,可以按照以下步骤操作: ### 1. 读取CSV文件的最后N行 通过`pandas.read_csv`的`skiprows`参数跳过前`总行数-N`行数据,结合`nrows`读取末尾指定行数。若文件包含标题行,需保留标题: ```python import pandas as pd import csv # 计算文件总行数(包含标题) with open('data.csv', 'r') as f: total_rows = sum(1 for _ in csv.reader(f)) N = 5 # 读取最后5行 skip = total_rows - N - 1 # 跳过前总行数-N-1行(保留标题) # 读取最后N行数据(含标题) df_tail = pd.read_csv('data.csv', skiprows=range(1, skip + 1)) ``` ### 2. 删除指定内容 假设需要删除`df_tail`中满足条件`column_name == 'value'`的行: ```python # 筛选需删除的行 mask = df_tail['column_name'] == 'value' to_delete = df_tail[mask] # 读取完整数据删除目标行 df_full = pd.read_csv('data.csv') df_updated = df_full.drop(to_delete.index) ``` ### 3. 保存修改后的文件 ```python df_updated.to_csv('data_updated.csv', index=False) ``` ### 完整代码示例 ```python import pandas as pd import csv def delete_last_n_rows_with_condition(file_path, column, value, n=5): # 计算总行数 with open(file_path, 'r') as f: total_rows = sum(1 for _ in csv.reader(f)) skip = total_rows - n - 1 # 跳过前总行数-n-1行 df_tail = pd.read_csv(file_path, skiprows=range(1, skip + 1)) # 筛选需删除的行 mask = df_tail[column] == value to_delete_indices = df_tail[mask].index # 读取完整数据删除 df_full = pd.read_csv(file_path) df_updated = df_full.drop(to_delete_indices) # 覆盖原文件 df_updated.to_csv(file_path, index=False) # 示例调用 delete_last_n_rows_with_condition('data.csv', 'status', 'expired', n=3) ``` ### 关键点说明 1. **高效读取末尾行**:通过`skiprows`跳过前`总行数-N`行,避免加载整个文件[^2]。 2. **条件删除**:使用布尔索引筛选目标行,确保精准删除。 3. **内存优化**:若文件过大,可分块读取(`chunksize`参数),但需更复杂的实现[^1]。
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