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RSS订阅原创 配准工具包 mermaid 的安装记录
4、ipython 版本与 python3.8 不兼容，重新安装一下。git 下载包，注意 setup.py 有个 bug，加上逗号即可。2、有些包会出现问题，所以把容易出问题的包先手动安装上正确的版本。
2023-09-21 14:33:32
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原创 conda镜像源操作
conda config --showconda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/conda config --remove channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
2021-11-03 17:04:15
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原创 医学影像处理数据操作
创建嵌套字典，用来存储数据dataset = {}'''...得到file_id'''dataset[file_id]={} # dataset={"file_id":{}}'''...得到file_name、img'''dataset[file_id][file_name]=img # dataset={ "file_id": {"file_name": array[...]} }
2021-06-11 10:12:29
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原创 python yield理解
对这篇文章中代码的理解def foo(): print("starting...") while True: res = yield 4 print("res:",res)g = foo() # 产生生成器对象print(next(g)) # next相当于一次点击yield事件，于是生成一个yield并返回4# output:4print("*"*20) # output:********************print(next(g)) #
2021-05-11 15:11:55
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原创 python中使用tarfile包压缩若干文件夹为tar格式
##python压缩若干文件夹为tar格式''' 获取想要的文件名列表，存在ls中 '''cur_path = os.getcwd() lsdir = os.listdir()ls = []for file in lsdir: if file[0:5] == "OASIS": ls.append(file) '''压缩文件'''' # tarfile.open只能打开文件，无法打开文件夹，所以这里自动创建了一个join.tar文件tar = tarfi
2021-05-10 17:19:36
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原创 pytorch中BCE和CrossEntropy Loss
BCE Loss vs CrossEntropy LossBCE Loss：target格式为one hotCrossEntropy：target格式为标签数字BCE Loss：支持仅有一个样本的计算。结果取所有标签数目的均值CrossEntropy：不支持一个样本的计算。结果取所有样本的均值BCE Loss：用sigmoid()后再用BCE Loss。包括(1-yi) ln(1-xi)的计算CrossEntropy：用softmax()。仅仅计算标签对应的input值的loss...
2021-03-24 15:54:37
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原创 矩阵求导
矩阵求导对矩阵的行列式求导因为泰勒展开对于向量形式，展开的一阶项应该是向量g(w)和w-w0的元素对应相乘，相应地矩阵形式也应该是对应相乘，这里介绍一个性质。下式中的A、B都是m×m，于是有...
2021-01-09 11:02:28
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原创 fMRI提取ROI时间序列
首先准备一个mask，reslice到与fMRI相同的分辨率。注意这个mask里面不是ROI的地方值为零，而且每个ROI体素的值都是这个ROI对应的编号。比如我用的Power 264 ROI，ROI值最大是264。然后用matlab写代码。把fMRI从四维转成二维去做会比较方便。fmri = spm_vol('ICA_denoised_sub-600001103037_task-rest_bold.nii');fdata = spm_read_vols(fmri);mask = spm_vol('r
2020-05-16 21:27:08
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原创 Win10下Caffe-windows配置历程，VS2015+CUDA8.0+python3.5，记录踩的坑
Win10下Caffe-windows漫漫配置路为了出错后能从网上找到答案，我用了经典的VS2015+CUDA8.0+cuDNN5.1+cmake3.11.1+Anaconda3.4(python3.5.2)+matlab2018a，但是仍然出现了不少问题，对于小白的我来说是一次煎熬与成长。主要参考教程：https://blog.youkuaiyun.com/havefun00/article/detai...
2019-03-02 10:13:05
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空空如也
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