DNA序列

最新推荐文章于 2021-09-09 11:20:25 发布

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分类专栏：华为机试字符串

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本文介绍了一种算法，用于从给定的DNA序列中找到具有最高GC比率的指定长度子序列。通过逐个检查所有可能的子序列并计算其GC比率来实现这一目标。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

题目描述：

一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例（定义为GC-Ratio）是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目（也就是序列长度）。在基因工程中，这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。

给定一个很长的DNA序列，以及要求的最小子序列长度，研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。

输入描述：

输入一个string型基因序列，和int型子串的长度

输出描述：

找出GC比例最高的子串,如果有多个输出第一个的子串

import java.util.Scanner;

public class Main
{
    public static void main(String[] args) {
        Scanner scanner = new Scanner(System.in);
        while (scanner.hasNext())
        {
            String str = scanner.nextLine();
            int len = scanner.nextInt();
            int index = 0;
            int GC = 0;
            for (int i = 0; i < str.length() - len; i++)
            {
                String sub  = str.substring(i, i + len);
                int G = 0;
                int C = 0;
                for (char c: sub.toCharArray())
                {
                    if (c == 'G')
                        G++;
                    if (c == 'C')
                        C++;
                }
                int tmp = G + C;
                if (tmp > GC)
                {
                    GC = tmp;
                    index = i;
                }
            }
            System.out.println(str.substring(index, index + len));
        }
    }
}