使用timeROC包绘制具有竞争风险的生存数据的多时间AUC值(R语言)
在生存分析中,我们经常需要评估预测模型在有竞争风险的生存数据中的性能。多时间AUC(Time-dependent Area Under the Curve)是一种常用的性能度量,用于衡量模型在不同时间点的预测准确性。在R语言中,我们可以使用timeROC包来计算和可视化多时间AUC值。
首先,我们需要安装和加载timeROC包。可以使用以下代码在R中完成:
install.packages("timeROC") # 安装timeROC包
library(timeROC) # 加载timeROC包
接下来,我们需要准备生存数据。假设我们有一个包含以下变量的数据集:
- 时间(Time):表示事件(例如死亡或失效)发生的时间。
- 事件状态(Event):表示事件是否发生,1表示事件发生,0表示事件未发生。
- 预测分数(Score):表示模型对事件发生的概率预测。
我们可以使用以下代码创建一个示例数据集:
# 创建示例数据集
data <- data.frame(Time = c(10, 15, 20, 30, 40),
Event = c(1, 1, 0, 1, 0),
Score = c(0.8, 0.6, 0.4, 0.9, 0.2))
现在我们可以使用ti
本文介绍了如何使用R语言的timeROC包来计算和可视化具有竞争风险的生存数据的多时间AUC值。首先,安装并加载timeROC包,然后准备包含时间、事件状态和预测分数的数据集。接着,使用timeROC函数计算AUC,并通过plot函数绘制AUC曲线,以评估模型在不同时间点的预测性能。
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