使用ggcoxzph函数检验模型是否满足等比例风险(R语言)
在生存分析中,等比例风险假设是一个重要的假设,它表示不同个体的风险比例在整个时间范围内是恒定的。为了检验模型是否满足等比例风险假设,可以使用R语言中的ggcoxzph函数来进行Schoenfeld残差图的可视化。
首先,我们需要安装并加载适当的R包。ggcoxzph函数可以在survival包中找到,因此我们需要确保该包已经安装。
# 安装survival包
install.packages("survival")
# 加载survival包
library(survival)
接下来,我们需要准备生存数据集,并为其拟合一个生存模型。在这个例子中,我们将使用lung数据集,该数据集包含来自NCI SEER(美国国家癌症研究所癌症流行病学计划)的肺癌患者的信息。
# 加载lung数据集
data(lung)
# 拟合生存模型
surv_model <- coxph(Surv(time, status) ~ age + sex + ph.ecog, data = lung)
现在,我们可以使用ggcoxzph函数来绘制Schoenfeld残差图,并检查模型是否满足等比例风险假设。
# 可视化Schoenfeld残差图
ggcoxzph(surv_model, p = 0.05)
在上述代码中,ggcoxzph函数接受一个C
本文介绍了如何在R语言中使用ggcoxzph函数检验生存分析模型的等比例风险假设。通过Schoenfeld残差图的绘制,观察残差与时间的关系,判断模型是否满足等比例风险。如果残差曲线随时间变化显著,则可能违反等比例风险假设,需要进一步分析和调整模型。
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