.txt经过数据处理之后存为.txt

原创于 2022-05-05 22:57:16 发布 · 351 阅读

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#python #深度学习 #tensorflow #机器学习

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本文探讨了一篇关于如何从.txt文件中正确提取并保存108个蛋白质序列的博客，作者分享了两种方法，方法一存在bug导致丢失部分数据，而方法二虽然解决了问题但效率不高。博主求助于大神指导，最终发现并修复了代码错误。

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对.txt文件，经过处理提取之后，存为.txt文件，可以采用以下代码：

file_1 = '/cancer_fasta_PA.txt'  #读取的.txt文件

file_3 = '/cancerPA.txt'       #要保存的.txt文件

# positive seq protein A
pos_seq_protein_A = read_file(file_1)   #这里的读取是前一个文章写的


outfile1=open(file_3,'w')

#方法一

for line in pos_seq_protein_A:
    outfile1.write(line+'\n')
outfile1.close

#方法二
for i in range(len(pos_seq_protein_A)):
    outfile1.write(pos_seq_protein_A[i]+'\n')
    if i>=91:
        print(pos_seq_protein_A[i])
outfile1.close

方法1存在一个bug，我怎么看怎么对，需要大神指点，我的.txt里面是108个蛋白质序列，但是经过方法一只剩91个（0-90），但是line确实能输出到最后一个。

于是我就采用方法二，每一个都输出，这样总能进去吧，但是依然不能，最后，我只能输出91个之外的，就得过且过粘贴了。

但我依然觉得代码没错，哪位大神路过指点一上下~

ps: 今天的科研不开心，搞了点啥啊！难过……