看了很多帖子都没有,自己记录一下
对数中心变换(函数需要另起文件保存,别忘了):
function clr_transformed_data = center_log_ratio(data)%把要处理的数据导入命名为data
% Calculate the geometric mean of the data
geo_mean = geomean(data);
% Take the natural logarithm of each component
log_data = log(data);
% Subtract the logarithm of the geometric mean from each component
clr_transformed_data = log_data - log(geo_mean);
end
逆变换:
function original_data = inverse_center_log_ratio(clr_transformed_data, geo_mean)
% Add the logarithm of the geometric mean to each component
log_data = clr_data + log(geo_mean);
% Take the exponential to revert the natural logarithm
original_data = exp(log_data);
end
该文章介绍了如何进行对数中心变换以处理数据,首先计算数据的几何均值,然后取自然对数并减去几何均值的对数,得到CLR变换后的数据。同时提供了逆变换的代码,通过加回几何均值的对数并取指数,恢复原始数据。
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