层次聚类(Hierarchical Clustering):使用R语言中的hclust包进行层次聚类

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本文介绍了如何使用R语言中的hclust包进行层次聚类,包括安装包、准备数据集、计算样本间距离、构建聚类树及可视化,并展示了将聚类树划分为特定数量簇的示例。

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层次聚类(Hierarchical Clustering):使用R语言中的hclust包进行层次聚类

层次聚类是一种常用的无监督学习方法,用于将数据集中的样本分组成层次结构。R语言提供了许多用于层次聚类的包,其中hclust包是其中之一。本文将介绍如何使用R语言中的hclust包进行层次聚类,并提供相应的源代码示例。

首先,我们需要安装并加载hclust包。可以使用如下命令完成:

install.packages("hclust")  # 安装hclust包
library(hclust)             # 加载hclust包

接下来,我们需要准备一个数据集来进行层次聚类。假设我们有一个包含多个样本的数据集,每个样本由多个特征组成。在这个示例中,我们使用一个简单的数据集,其中包含5个样本和2个特征。数据集可以用一个矩阵或数据框表示,如下所示:

# 创建示例数据
data <- matrix(c(1, 2, 3, 4, 5, 2, 4, 6, 8, 10), nrow = 5)

现在我们已经准备好数据集,可以开始进行层次聚类。层次聚类的关键步骤是计算样本之间的相似度或距离,并根据相似度或距离构建一个聚类树。在R语言中,可以使用dist函数计算样本之间的距离,并使用hclust函数构建聚类树。下面是一个完整的层次聚类的例子:

# 计算样本之间的距离
dist_m
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