基于非靶向和靶向代谢组学分析婴幼儿血管瘤的氨基酸代谢

研究通过非靶向和靶向代谢组学方法分析了婴儿血管瘤内皮细胞(HemECs)的代谢谱,发现氨基酸代谢的显著变化,尤其是谷氨酰胺、精氨酸和天冬酰胺。这些代谢物在多种代谢通路中富集,可能在血管瘤的发生发展中起关键作用。

文章标题:Integrated nontargeted and targeted metabolomics analyses amino acids metabolism in infantile hemangioma

发表期刊:Frontiers in Oncology

影响因子:5.738

作者单位:四川大学华西医院

百趣提供服务:发现代谢组学Classic、氨基酸高通量靶标代谢组学

研究背景

婴儿血管瘤(Infantile hemangioma, IH)是婴幼儿群体中常发的良性肿瘤,其特征为出生后1年的增殖阶段及数年的自发消退阶段。在IH的增殖阶段,血管瘤内皮细胞(Hemangioma-derived endothelial cells, HemECs)是主要的细胞类型。作者先前的研究揭示了糖酵解过程在IH发病机制中起着重要的作用,但是目前研究对于HemEC在IH发展中的代谢特征和作用研究甚少。因此,本研究基于非靶向和靶向代谢组学的方法发现了HemEC代谢谱的变化,探讨了IH发展的复杂机制。

研究结果1非靶向代谢组学发现HemECs代谢谱变化

百趣提供了非靶向代谢组学检测,对HemECs及人脐静脉内皮细胞(Human umbilical vein endothelial cells, HUVEC)检测结果进行分析。结果显示:正离子模式下共筛选出216个差异代谢物,其中133个上调差异代谢物、83个下调差异代谢物,负离子模式下共筛选出128个差异代谢物,其中74个上调差异代谢物、54个下调差异代谢物(图1)。这些代谢物主要为氨基酸及其衍生物。

 

图1 通过非靶向代谢组学技术分析测定HUVEC和HemEC之间的差异代谢物

为了研究IH发育中涉及的代谢组学途径,对所有差异代谢物进行富集分析。结果显示:正离子模式下,共富集

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