fMRI预处理-DPABI

最新推荐文章于 2025-04-26 09:33:28 发布
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#预处理 #fMRI

本文详细介绍了fMRI预处理工具DPABI的使用，从下载安装到配置MATLAB路径，再到dpasf预处理流程，包括格式转换、头动校正、原点校正、T1分割、无关变量回归、标准化、平滑、去漂移和滤波等步骤。每个步骤的细节和注意事项均有阐述，强调预处理顺序需根据实验方案灵活调整。

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  1. dpabi下载及安装
    dpabi下载后，存储在任意位置，并将存储路径添加到matlab的path，例我的dpabi存储在"E:\matlab\soft\DPABI_V4.0_190305"，添加步骤如下：在这里插入图片描述
    在这里插入图片描述
  2. 运行dpabi
    命令行输入dpabi，然后回车
    在这里插入图片描述
    一路确定
    在这里插入图片描述
    在这里插入图片描述
    选择dpasf
    在这里插入图片描述
    选择高级版本
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DPABI详细使用教材——数据准备、预处理流程、数据分析流程
从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
03-21 5万+
严老师的官方教程：官网 DPABI(用于脑成像的数据处理和分析的工具箱)的下载和安装步骤,请参阅博客： 安装教材 DPABI版本：V4.3_200401 MATLAB版本：2018a 目录 一、数据准备 二、预处理 三、数据分析 四、关于预处理流程 五、其他设置 一、数据准备 （1）如果是数据的DICOM格式，整理成以下格式（注意文件夹的命名方式）： 如果觉得不是很清楚，可以在官网下载Demo数据（http://rfmri.org/DemoData），参照里面的文件格式进行整理即可。 （2）如果数据是.
dpabi预处理报错——索引超出矩阵维度
m0_71476694的博客
07-24 4121
像是这种，一定要检查是不是重命名的时候存在空格！ 红圈处，就是容易存在空格，需要在重新命名看一下。 另外，一定要多看看官网，如果预处理一直报错，建议先用官网的demo data演示一下，如果没问题，就说明系统跟软件（spm matlab dpabi）安装没有出错，那么就是数据准备这一块出了错，还需要自己多排查。 更多报错信息，请留意官网http://rfmri.org/DPABIErrorHandling ...
【DPABI教程】DPARSF详细教程笔记
热门推荐
Absolute Zero
08-19 9万+
前言 最近在学习使用DPABI对fMRI数据进行分析处理，在处理过程当中难免会遇到一些小问题，而且处理步骤繁多，因此对DPARSF（主要针对体空间分析）的整个处理流程整理成笔记，中间会加上一些自己在处理过程当中遇到的问题和思考，但主要还是参照严老师的教学视频整理的，尽可能把细节详细地记录下来，希望在今后预处理和数据分析的时候尽量少出错。 严老师的官方教程：http://rfmri.org/Course DPABI版本：V4.3_200401 （这是目前最新的版本，听说不久后将会推出新版本，具体可关注官
使用 DPABI 进行 rs-fMRI 预处理的完整流程
最新发布
yuzhounh的专栏
04-26 700
用户需根据实验设计调整参数，并通过QC指标确保数据可靠性，为后续统计分析奠定基础。- **质量控制**：排除头动过大被试（平移>2-3 mm，旋转>2-3°），计算帧位移（Frame Displacement, FD）和平均FD（阈值通常为FD < 0.2-0.5）。- **参数设置**：需输入重复时间（TR）、层数（如32层）、扫描顺序（如隔层升序/降序），并指定参考层（通常为中间层）。- **配准与分割**：将T1像与功能像配准，分割为灰质（GM）、白质（WM）、脑脊液（CSF），用于后续去噪。
Dpabi数据预处理（无T1结构图像）
weixin_46336401的博客
03-09 4522
使用Dpabi对fMRI功能性图像（无T1图像）进行预处理
基于DPABI的RS-fMRI预处理理解及详细操作步骤
learner_jj的博客
04-12 8998
记录DPABI对rs-fMRI 数据进行预处理的详细步骤
基于DPABI和SPM12的任务态fMRI分析笔记1——预处理
Sophia2023的博客
01-24 1万+
前言 原理简介 预处理
ADNI_rs-fMRI数据预处理过程_matlab.docx
05-25
ADNI_rs-fMRI数据预处理过程_matlab 本文档旨在介绍ADNI_rs-fMRI数据预处理过程，使用Matlab作为主要工具，整个流程共八步。 步骤1：下载DICOM格式数据 在ADNI官网下载Resting State fMRI数据，登录账号和密码，...
大小鼠fmri预处理
04-22
好的，我现在需要处理用户关于大小鼠fMRI预处理方法、工具和流程的查询。首先，用户明确提到了大小鼠，所以需要注意啮齿类动物与人类数据处理的不同之处。根据提供的引用，特别是引用[2]和[3]，思影科技和DPABI可能...
DPABI使用教程
qq_54641516的博客
07-24 6638
DPABI使用
DPABI_StatisticalAnalysis_stiff3ai_DPABI_dpabi统计流程_统计分析_
09-30
代码基于matlab的DPABI软件包，用于对预处理结果进行统计分析，包括t检验，ANOVA等
DPABI是一个功能强大的基于MATLAB和Python的脑成像数据分析工具包，用于处理和分析功能磁共振成像（fMRI）数据
YOLOv6666的博客
09-17 1992
本文将介绍如何下载和安装DPABI的Python版本，并提供相应的源代码。为了能够在任何目录下使用DPABI，你需要将DPABI的安装路径添加到系统的环境变量中。打开终端（对于Windows用户，可以使用命令提示符或PowerShell），导航到解压缩后的文件夹（dpabi-xxx）。DPABI的Python版本是基于Python语言的，因此在开始之前，确保你的计算机已经安装了Python。请注意，本文提供的是DPABI的Python版本的安装步骤。至此，你已经完成了DPABI的下载和安装过程。
基于Dpabi的功能连接
weixin_54794458的博客
08-28 7736
(2)去除前10个时间点(Remove first 10 times points)：由于机器刚启动、被试刚躺进去也还需适应环境，导致刚开始扫描的数据很不稳定，所以一般需要删除前几个时间点。本文的数据删除了前10个时间点。（4）头部矫正(Realign)：被试再扫描过程中不可避免地会有头部运动，所以需要对数据进行头部矫正，将全部时间点的数据在空间上与第一个时间点采集的数据对齐。（6）平滑(Smooth)：提高数据的信噪比，选用高斯平滑核，平滑核的大小一般选取体素大小的2-3倍，此处选择大小[8 8 8]。
【Dpabi】QC板块应用的初步学习
m0_61095786的博客
03-08 2074
dpabi QC功能的使用
DPABI 的下载与安装
learner_jj的博客
10-06 3785
下载并在Matlab中成功安装fMRI处理工具DPABi
DPABI安装教程
qq_42356925的博客
04-02 1万+
DPABI是是中科院心理研究所严超赣老师团队开发的一款磁共振脑影像数据分析工具包。基于SPM，在安装DPABI之前需要安装好SPM，才能正常使用。SPM的安装方法见文matlab2021a版本条件下安装spm_kidllll的博客-优快云博客 1、下载安装包 下载地址：DPABI: a toolbox for Data Processing & Analysis for Brain Imaging | The R-fMRI Network 2、将下载好的dpabi文件夹移动到matl..
python批处理原始核磁数据用于DPABI
clancy_wu的博客
09-17 1075
师姐给了一个任务
基于DPABI的精神分裂患者脑图特征提取和统计分析
hanzitino的博客
06-22 1万+
参考博客：https://blog.youkuaiyun.com/ScarlettGuo/article/details/107889578
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