如何提取fMRI的时间序列,以及构建功能连接矩阵(functional connectivity)

本文介绍了从fMRI数据中提取时间序列并构建功能连接矩阵的方法,涉及预处理、解剖模板应用、皮尔逊相关系数计算等步骤,通过实际操作展示如何进行功能连接分析。

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概述

上图说明了在图论分析中从fMRI中提取复杂网络的主要步骤。

步骤一: 对采集的功能磁共振成像数据进行许多预处理步骤,包括切片之间的时间校正、重新对准、图像配准、基于分割的归一化和空间平滑。需要注意的是预处理步骤的选择和顺序可能会影响最终图指标测量的范围。

预处理步骤可以参考:DPABI详细使用教材——数据准备、预处理流程、数据分析流程

步骤二: 为了探索大规模的大脑网络,应用了适当的分割方案,例如解剖学自动标记图谱,将整个大脑划分为几个皮质和皮质下的解剖单元。

步骤三: 通过平均该特定区域内的所有体素的时间进程平均作为该脑区的时间序列。

步骤四 : 执行在前面部分中回顾的连通性方法之一,诸如相关分析,以确定大脑不同脑区间的时间序列的成对关联。

步骤五 : 通过对相关

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