近日,西北大学范伯格医学院Yuan Luo副教授发表在
NeurIPS 2022
上的论文“
SHINE: SubHypergraph Inductive Neural nEtwork
”。
超图神经网络
可以对图的节点之间的多路连接进行建模,这在基因医学等现实世界的应用中很常见。
现有的超图神经网络模型通常侧重于节点级或图级推理,学习超图的子图的强大表示的需求尚未得到满足。SHINE联合优化了端到端子图分类和超图节点相似性正则化的目标。SHINE使用双重注意力信息传递同时学习基因和通路的表征。学习到的表示通过子图注意力层进行聚合,并用于训练用于归纳子图推理的多层感知器。实验表明,SHINE显著优于所有比较模型,并产生了具有功能见解的可解释疾病模型。
论文摘要:超图神经网络(Hypergraph neural networks)可以对图节点之间的多路连接进行建模,这在遗传医学等现实应用中很常见。 特别是,遗传途径或基因集编码由多个基因驱动的分子功能,自