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本文介绍了ClusterProfiler包中的多种富集结果可视化方法，包括条形图、点图、基因概念网络、类似热图的功能分类、富集图、生物主题对比、UpSet Plot、GSEA结果的脊线图和运行得分图，以及enriched terms的PubMed趋势分析。这些工具帮助研究人员理解和解释基因集富集分析和过度表达分析的结果。
clusterProfiler: universal enrichment tool for functional and comparative study
- ClusterProfiler: 用于功能和比较研究的通用富集工具
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- 12. 功能丰富结果的可视化
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- 12.1 条形图（Bar Plot）
- 12.2 点图（Dot plot）
- 12.3 基因概念网络（Gene-Concept Network）
- 12.4 类似热图的功能分类（Heatmap-like functional classification）
- 12.5 富集图（Enrichment Map）
- 12.6 生物主题对比（Biological theme comparison）
- 12.7 UpSet Plot
- 12.8 GSEA 结果表达分布的脊线图（ridgeline plot）
- 12.9 GSEA结果的running score和preranked list
- 15.9 enriched terms的pubmed趋势
ClusterProfiler: 用于功能和比较研究的通用富集工具
12. 功能丰富结果的可视化
enrichplot包实现了几种可视化方法来帮助解释富集结果。 它支持可视化从 DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler (Yu et al. 2012)、ReactomePA (
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