大数据最全3D Slicer - 图像分割标注教程_3dslicer标注(2)，大数据开发基础学习教程

最新推荐文章于 2025-04-16 09:00:00 发布
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在3D Slicer(4.10.1)中进行三维体数据的图像分割标注。
扩展教程：
3D Slicer - 医学图像检测标注教程(矩形框)
3D Slicer - 医学图像检测标注教程(导入查看标签与修改标签)

1. 读取数据

三维体数据一般为DICOM格式或者NIFIT格式，
DICOM：
将包含.dcm文件序列的文件夹拖入3D Slicer，或者点击左上角的

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注意，有多个Segment的时候，若只想保存其中一个，则需要将其他的Segment设为不可见，即关闭Segment右侧的小眼睛。每次保存的是同级目录下的所有设为可视的Segment。论你是正从事IT行业的老鸟或是对IT行业感兴趣的新人，都欢迎加入我们的的圈子（技术交流、学习资源、职场吐槽、大厂内推、面试辅导），让我们一起学习成长！"，选择路径进行保存。保存为DICOM格式后，也可以重新打开，然后将其保存为NIFIT格式。将包含.dcm文件序列的文件夹拖入3D Slicer，或者点击左上角的。
Elasticsearch 单节点部署教程，以及踩坑记录_elasticsearch单节点配置(2)
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本文详细介绍Elasticsearch在打开和关闭Security情况下的安装使用，以及对安装过程遇到的一些问题进行记录，帮助大家在centos7系统中够顺利安装和使用Elasticsearch。后续将介绍集群安装和使用。本人是一个从小白自学计算机技术，对运维、后端、各种中间件技术、大数据等有一定的学习心得，想获取自学总结资料（pdf版本）或者希望共同学习，关注微信公众号：it自学社团。后台回复相应技术名称/技术点即可获得。（本人学习宗旨：学会了就要免费分享）
医学图像可视化工具介绍（一）-3D Slicer
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3D Slicer 是一个免费的开源软件平台，用于医学、生物医学和其他 3D 图像的可视化、处理、分割、配准和分析。Slicer 的功能包括：（1）读/写DICOM图像和多种其他格式；（2）三维图像、多边形网格和体积渲染的交互式可视化；（3）手动编辑和标记图像；（4）使用刚性和非刚性算法融合和共同配准数据；（5）图像自动分割；（6）跟踪图像引导程序的设备。3D Slicer可以高效的帮助用户可视化各种类型的医学图像。安装打开后可以看到主页面如下。更多信息可以参考。
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我们将使用Scratch的角色和背景绘图工具来创建各种动物形象和场景，并使用事件、动作和外观积木块来编写脚本。此外，我们还将使用变量和运算积木块来跟踪用户的得分和进度，并使用控件积木块来设计用户界面和导航菜单。我们将使用Scratch的运动和物理积木块来模拟物体的运动，并使用变量和运算积木块来计算物体的位置、速度和加速度。我们将使用Scratch的控件积木块来检测玩家的输入，使用运算积木块来生成随机数和计算得分，以及使用事件和动作积木块来控制游戏的流程。添加变量来记录球的速度和位置，以便进行更精确的模拟。
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多年互联网一线运维开发经验，为多家企业独立开发过相关运维管理平台，负责过近千台服务器运维管理工作，对运维及运维开发岗位有深入理解。
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1. 部署jdk，不建议使用openjdk 下载jdk1.8.0_102.tgz文件 官方下载地址：https://www.oracle.com/cn/java/technologies/javase/javase-jdk8-downloads.html 创建java家目录 mkdir -p /App/java/ tar -zxvf jdk1.8.0_102.tgz -C /App/java #set for java export JAVA_HOME=/App/java/jdk1.8.0_102
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3d slicer上颌骨分割标注
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### 如何在3D Slicer中对上颌骨进行分割和标注 #### 准备工作 确保已经成功安装并配置好3D Slicer环境[^1]。加载含有目标解剖结构（即上颌骨）的医学影像数据集到软件内。 #### 加载图像数据 通过`File -> Add Volume...`菜单选项导入DICOM或其他支持格式的文件，确认所选体素代表的是头颈部区域扫描结果，以便后续操作能够聚焦于上颌部位。 #### 使用Segment Editor模块进行初步划分 进入`Modules -> Segmentations -> Segment Editor`界面，在此可以利用多种工具来定义感兴趣区(ROI)，对于复杂形状如上颌骨而言，“Draw”、“Paintbrush”等功能尤为适用；另外还可以借助阈值调整功能自动识别特定密度范围内的像素作为初始轮廓的一部分。 ```matlab % 这里提供了一个简单的MATLAB脚本用于批量处理类似的分割任务， % 用户可以根据实际情况修改参数适应具体需求。 function segmentMaxilla(inputVolumePath, outputLabelMapPath) % Load input volume data vol = dicomread(inputVolumePath); % Define threshold values suitable for maxillary bone segmentation lowerThreshold = 200; % HU units upperThreshold = 3000; % Apply thresholding to create binary mask of the maxilla region bwMask = imbinarize(vol, [lowerThreshold/1000, upperThreshold/1000]); % Save resulting label map as NIfTI file compatible with 3D Slicer niftiwrite(bwMask, outputLabelMapPath); end ``` #### 应用模型编辑器细化边界 完成粗略勾勒之后，转至`Model Maker`插件进一步优化表面几何形态，消除可能存在的噪声干扰项，并使最终形成的三维实体更加贴合实际生理特征。 #### 添加标签说明 最后一步是在生成好的分段对象上附加必要的元数据描述——这通常涉及到设置颜色编码方案以及撰写简短的文字解释，方便日后查阅或与其他研究者交流成果时使用。可通过右键点击左侧项目列表中的相应条目选择属性对话框来进行上述设定。
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