公开数据集分享(一)-MMWHS

公众号中有粉丝私信我,向我咨询公开数据集(MMWHS)的数据,下面我给大家大概介绍一下这个数据集,并提供我之前关于这个数据集做的一些工作。

MMWHS-是一个全心脏分割的工作,一共是8类,数据集的具体信息和下载链接,可以参考:

http://www.sdspeople.fudan.edu.cn/zhuangxiahai/0/mmwhs/

下面的这个链接是我的github,分享一下对于该数据集我之前做的一些工作,欢迎大家Star与关注。

https://github.com/Xavier-cvpr/MMWHS

欢迎大家关注并且留言,后续会有更多的学习资源分享链接

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<think>好的,用户需要关于MMWHS数据集的信息,包括下载方式、使用说明、格式介绍以及它在医学图像分割中的应用。首先,我需要回忆下之前提供的引用内容,特别是引用3,里面提到了MMWHS数据集来自MICCAI 2017挑战赛,包含20个3D心脏CT容积,标注了7个心脏结构。预处理步骤包括强度归化和调整切片大小到160x160。 接下来,用户可能需要更详细的信息,比如具体的下载链接、数据格式、文件结构、使用许可等。不过根据现有的引用,可能没有直接给出下载链接,但可以建议用户访问MICCAI挑战赛的官方网站或者相关平台查找。另外,需要提到数据集的组成,比如CT和MRI模态是否存在,不过根据引用3,MMWHS是CT数据,但不确定是否有其他模态,可能需要确认。 关于使用说明,引用3提到预处理步骤,如强度归化和调整分辨率,这些可以详细说明。另外,数据分割的应用场景,比如心脏结构分割,可以结合引用2中的半监督学习在医学图像分割中的应用,说明MMWHS可能用于这类研究。 格式方面,可能数据集是NIfTI格式,常见于医学图像,需要确认。如果没有明确信息,可以建议用户查看数据集文档或相关论文。 用户还可能关心数据集的划分,比如训练集、测试集的数量,是否需要注册才能下载,以及引用要求。需要提醒用户遵守数据使用协议,正确引用来源。 最后,生成相关问题时要涵盖数据集的应用、预处理、半监督学习、挑战以及多模态数据比较等方面,帮助用户进步探索。</think>### MMWHS 数据集信息整理 #### 1. **数据集简介** - **来源**:MMWHS(Multi-Modality Whole Heart Segmentation)数据集来自**MICCAI 2017挑战赛**,主要用于心脏结构的全自动分割任务[^3]。 - **数据内容**: - 包含**20个3D心脏CT容积**(另有部分版本可能包含MRI数据,需根据具体子集确认)。 - 标注涵盖心脏的**7个解剖结构**:左心室、左心房、右心室、右心房、心肌、升主动脉、肺动脉。 #### 2. **数据格式与预处理** - **原始格式**:医学图像常用格式(如NIfTI或DICOM),需通过专业工具(如ITK-SNAP、3D Slicer)查看。 - **预处理**: 1. **强度归化**:调整图像灰度范围以消除设备差异。 2. **分辨率统**:使用双线性插值将切片大小调整为$160 \times 160$像素。 3. **数据增强**:可能包括旋转、翻转等操作以提升模型泛化性。 #### 3. **下载与使用** - **下载途径**: - 访问MICCAI挑战赛官网(如[MMWHS官方页面](https://www.sdspeople.fudan.edu.cn/zhuangxiahai/0/mmwhs/))或学术平台(如Grand-Challenge.org)。 - 部分镜像可能发布于[Zenodo](https://zenodo.org/)或[Kaggle](https://www.kaggle.com/)- **使用要求**: - 需遵守数据使用协议(如非商业用途、署名要求)。 - 需医学图像处理工具(如SimpleITK、PyTorch)加载和分析数据。 #### 4. **应用场景** - **研究方向**: - 心脏结构分割(如心室、心房体积计算)。 - 半监督/弱监督医学图像分割(参考[^2]中SSL方法)。 - 跨域迁移学习(针对不同扫描仪或临床中心数据差异)[^2]。 #### 5. **示例代码(数据加载)** ```python import nibabel as nib import numpy as np # 加载NIfTI格式的CT图像和标签 ct_volume = nib.load('ct_scan.nii.gz').get_fdata() label_volume = nib.load('ct_label.nii.gz').get_fdata() # 可视化某轴向切片 import matplotlib.pyplot as plt plt.imshow(ct_volume[:, :, 50], cmap='gray') plt.axis('off') plt.show() ``` #### 6. **注意事项** - **标注质量**:需验证标签准确性,部分边缘区域可能存在模糊性。 - **域偏移问题**:不同扫描仪采集的数据可能导致模型性能下降(参考中跨域分析)。 ---
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