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RSS订阅原创 在R中进行偏相关分析
利用R语言进行偏相关分析这里推荐两个R包进行该分析：ggm和ppcor。但ggm只能提供偏相关系数，无法提供 p 值；ppcor能提供相关系数和p值，并能选择相关系数计算方法。ggm使用方法pcor(u, S)，u, a vector of integers of length > 1. The first two integers are the indices of variables the correlation of which must be computed. The res
2022-04-05 16:33:36
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原创 如何在linux中后台运行R
如何在linux中后台运行R重要提示：本部分参考、借鉴于本博客首先运行Rscripts命令，查找Rscript所在位置。which Rscript在我的电脑得到信息如下：/usr/local/bin/Rscript在Notepad++准备代码,首行应为“#! /usr/local/bin Rscript”其他代码如R中一致，切忌不要忘了packages的调用最后准备完毕后，将代码文本命名为 my.R,并将其放入当前目录下代码运行需要的文件统一放到当前目录下，或在代码文件中都已明确表明
2020-12-21 16:11:20
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原创 外部数据导入qiime2软件内部
外部数据导入qiime2软件内部 序列、OTU(Feature) Table导入qiime2较为简单，可以按官方推荐方式进行导入。下面重点介绍taxonomy导入方式：1. TSV格式 创建TSV表格，切记不能含有表头（qiime2会自己生成headline），内容按照OTUID和taxonomy两列排列。代码如下：qiime tools import \--input-path taxonomy.txt
2020-11-24 00:18:19
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原创 Qiime2 软件安装
Qiime2 软件安装 近日开始学习Qiime2，本人是Windows10系统，但本次并没有选择安装双系统来安装Qiime2软件。而是在Microsoft Store中安装了Ubuntu 20.0 LTS来安装Qiime2。现将过程记录如下，以作纪念。前言 整个安装基本参考Qiime2官网推荐方法和刘永鑫老师推荐方法。1. Ubuntu安装 Windows 10系统上安装Ubuntu较为简单，通过Microsoft Store搜索该软件，然后安装即可。 Ubuntu安装需要持续几分钟，
2020-06-14 11:58:30
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空空如也
空空如也
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