Cytoscape Fill Color -＞ Column 的这个select下拉菜单里，没有degree 只有name, share name本来应该有包括 Degree 在内的很多选项

您说得对，我完全理解错了。您的问题是：在 Fill Color -> Column 的这个下拉菜单里，本来应该有包括 Degree 在内的很多选项，但现在只显示了2个。您需要的是让这个列表变得完整，显示出所有可用的属性（比如 Degree）。

这个问题非常常见，其核心原因是：Cytoscape 的 Style 面板中的 Column 下拉菜单，其内容直接来源于您的 Node Table（节点数据表）。如果 Node Table 里没有 Degree 这一列，或者这一列没有被正确识别，那么它就不会出现在下拉菜单中。

下面的流程图清晰地展示了诊断和解决这个问题的完整路径：
flowchart TD
A[Column下拉菜单选项过少] --> B[检查Node Table
确认属性列是否存在]
B --> C{Node Table中有Degree列吗？}

C --o|有| D[检查数据类型]
D --> E{是数值类型吗？}
E --o|是| F[问题解决<br>返回Style面板刷新查看]
E --x|否/是字符串| G[“删除该列并重新计算<br>(Tools -> Analyze Network)”]
C --x|没有| H[“执行网络分析<br>生成属性列<br>(Tools -> Analyze Network)”]

G --> I[下拉菜单选项变完整]
H --> I

I --> J[最终成功应用属性映射]

下面我们来详细讲解每一步的具体操作。

解决方案：让 “Degree” 出现在下拉菜单中

请您按照以下步骤操作，核心是先确保 Node Table 中有正确的 Degree 列。

第1步：检查节点数据表

在 Cytoscape 主窗口的左下角，点击 Node Table 按钮。这会打开一个数据表格，里面列出了网络中所有节点及其属性。
查看表格的列标题：仔细查看表格的列标题，寻找名为 Degree 的列。
◦ 情况A：有 Degree 列。请跳至第2步。

◦ 情况B：没有 Degree 列。这说明您还没有为当前网络计算拓扑属性。请直接跳至第3步。

第2步：检查 Degree 列的数据类型（非常重要！）

如果存在 Degree 列，但它仍然没有出现在 Fill Color 的 Column 下拉菜单中，几乎可以肯定是数据类型错误。

• 观察列标题：在 Node Table 中，看 Degree 列的标题旁边是否有一个 abc 的图标。这表示 Cytoscape 将它错误地识别为“字符串”文本属性。而 Fill Color 的映射需要的是数值属性（图标为 123 或 1.2）。

• 解决方法：

1.  在 Node Table 中，右键点击 Degree 列的标题。
2.  选择 Delete Column 将其删除。
3.  现在，您需要重新创建它，请继续第3步。

第3步：计算网络属性（生成 Degree 列）

这是最关键的一步，它会自动创建包括 Degree 在内的多个拓扑属性列。

在 Cytoscape 顶部菜单栏，点击 Tools。
在下拉菜单中选择 Analyze Network。
在弹出的对话框中，确保选中了您当前的网络，然后点击 OK。
Cytoscape 会快速计算整个网络的拓扑属性。计算完成后，再次打开 Node Table，您会发现表中多出了很多新列，例如 Degree, Betweenness Centrality, Closeness Centrality 等，并且它们的数据类型都是数值型。

第4步：返回 Style 面板查看结果

现在，回到左侧的 Style 面板。

点击 Fill Color 属性。
再点击 Column 右边的下拉菜单。
现在，您应该能看到一个很长的列表，里面包含了 Degree 以及刚才计算出的所有其他网络属性。

总结一下核心逻辑：
Style 面板下拉菜单的选项来源于 Node Table 中的列。您需要通过 Tools -> Analyze Network 这个操作，来让 Cytoscape 为您的网络“计算”出 Degree 这样的属性列。一旦 Node Table 里有了正确的列，下拉菜单中自然就会出现。

现在，您就可以选择 Degree，然后通过 Continuous Mapping 来设置颜色梯度，实现按节点重要性着色的效果了。如果还有问题，请随时提出！