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RSS订阅原创 AlphaFold2：Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold（蛋白质结构预测）
以前的蛋白质设计，都是从自然界寻找大量的拥有一定功能的蛋白质的突变氨基酸序列，用湿实验手段人工合成该突变蛋白质，然后再去测试它的功能性状是否有所提高。那时，只通过提供蛋白质序列来直接了解蛋白质的功能是根本不可能的。也就是说人类不可能实现蛋白质的从头设计。因此，需要准确的计算方法来填补这一差距，实现大规模的结构生物信息学研究。基于氨基酸序列来预测蛋白质将采用的三维结构，即 “蛋白质折叠问题” 的结构预测部分，已经成为一个重要的研究问题超过50年。尽管近年来取得了一些进展，但现有的方法在没有类似结构可供参考的
2024-08-18 14:44:23
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原创 RFdiffusion：De novo design of protein structure and function with RFdiffusion（蛋白质扩散设计）
RFDiffusion在加噪（Forward）过程中，需要对三维结构坐标进行局部扰动，作者选择在residue gas的机制上独立地对旋转和平移矩阵（6维）添加高斯噪音从而获取训练数据，区别于其他扩散模型使用一维蛋白质的主链二面角或二维的残基距离矩阵，从而让模型拥有更高维度上的表征能力，此外这种表示形式还具有全局的旋转不变性，让模型能更加稳定的训练。RFdiffusion模型其最大的创新点在于将蛋白结构预测模型巧妙地用扩散模型的方式进行训练微调，可以更好的描述蛋白质序列和结构之间的隐藏关系。
2024-08-18 14:09:34
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原创 Bidirectional Copy-Paste for Semi-Supervised Medical Image Segmentation
期刊：2023 IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR)源码链接：https://github.com/DeepMed-Lab-ECNU/BCPz。
2024-08-18 13:33:46
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空空如也
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