【blast安装及使用】如何在Linux配置blast做序列对比

  下载文件路径：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/
  选择预编译的linux版本

下载命令

wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz

对文档解压

tar -zxvf ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz

将其移至自己想要的安装目录中

mv ncbi-blast-2.2.30+ 自己的目录路径 # 移动
cd 自己的目录路径                    # 进入本地进程安装路径
mv ncbi-blast-2.2.30+ blast        # 修改目录名

需要将blast+的路径加入到环境变量中，方便以后的调取
可以用 vim 编辑器，在 ~/.bashrc文件 输入如下所示：
按 i 进入输入模式，在最后加入以下行：

export PATH=自己的路径:$PATH

按 esc 退出输入模式，进入命令模式。输入 :wq 保存并退出
使之生效

source ~/.bashrc

验证

blastn -version

参考文献

[1]生信基础 | 使用BLAST进行序列比对
[2]Linux安装blast+及使用
[3]Linux解压文件出现错误
[4]Linux下BLAST的安装与使用
[5]Ubuntu 下Blast+工具的安装与环境配置