zaprily的博客

先放上fastStructure 网址 熟悉生信分析应该都知道admixture，就是做群体层次分析的一个软件，fastStructure基本上对标的是Ad的两大功能：未知的个体群体分层分析，有监督的群体分层分析. 由于Ad是已经打包好的所以直接调用就很方便，但是由于fastStructure是在Cython和gsl之上的就很容易安装报错，一般就是两大方向的错误，文件路径没调整对，还有就是安装版本的问题，如果用root账户安装的一般来说路径问题比较少，基本就按照软件给出的README.md安装就可以，这里主

数据预处理（特征工程） 1.处理负值（or outlier） 标记有问题的特征，但是不删去 def getres1(row): return len([x for x in row.values if type(x)==int and x<0]) data['neg1'] = data[data.columns].apply(lambda row:getres1(row),axis=1) data.loc[data['neg1']>20,'neg1'] = 20 #平滑处理 2.