Linux 中出现 -bash: syntax error near unexpected token `newline‘问题解决方法

问题：在linux系统中提交shell脚本时有时会出现以下报错：

    -bash: syntax error near unexpected token `newline'

或者

问题出现原因：在windows下编译过的文件换行符为^M$,而linux系统识别换行符为^U$, 所以在Windows系统编辑的脚本在Linux中无法运行。

可以通过以下指令看到换行符情况：

    cat -A name.sh

问题解决：利用dos2unix进行转换

下载dos2unix：conda install -c bioconda dos2unix

使用：dos2unix name.sh

运行结束上述指令后可再次通过cat -A name.sh查看变换情况。

再次提交脚本，就没有报错啦！