本地blast

本文详细介绍了如何下载并安装本地blast版本2.2.31+,包括解压、环境变量设置、数据库目录创建等步骤,以及如何在bash中进行路径管理和设置BLAST数据库路径。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

目前本地blast的版本:


下载:

wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST/

解压:

tar zxvpf ncbi-blast-2.2.31+-x64-linux.tar.gz

之后生成一个文件夹:

ncbi-blast-2.2.31+

Under bash, the following command appends the path to the new BLAST bin directory to the existing PATH setting:

export PATH=”$PATH:$HOME/ncbi-blast-2.2.31+/bin”

To manage available BLAST databases, a subdirectory named db should be created. For the example installation, the following command creates such directory under ncbi-blast-2.2.31+ directory:

mkdir ./ncbi-blast-2.2.31+/db

Similar approaches described above can be used to set the BLASTDB value under bash:

export BLASTDB=”$HOME/ncbi-blast-2.2.29+/db”


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