DPDDI:药物相互作用的深层预测器
论文题目 | DPDDI: a deep predictor for drug-drug interactions |
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论文出自 | BMC Bioinformatics ,2020 |
论文链接:DPDDI: a deep predictor for drug-drug interactions
一、研究背景?
现有的计算方法大致可以分为两类:
基于文本挖掘的方法和基于机器学习的方法。
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基于文本挖掘的方法:从科学文献、电子病历、保险索赔数据库和FDA不良事件报告系统中发现并收集带注释的DDI。它们在构建DDI相关数据库时非常有用。
- 不足:这些方法无法检测未注释的DDI,也无法在进行组合处理之前判断潜在的DDI。
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基于机器学习的方法:–>可以识别未注明的潜在药物相互作用。包含特征提取和监督预测两部分。
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特征提取:根据药物特性以特征向量的形式表示药物,例如化学结构、靶点、副作用、药物临床观察。
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监督预测器
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