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原创 1分钟学会使用5种网络代理加速软件安装
网络代理可解决网络慢、访问受限等问题。本文介绍Linux、conda、R、apt等环境下代理的配置方法。Linux中,用export命令临时设置或修改配置文件永久设置代理。conda通过conda config命令设置代理。R语言用Sys.setenv临时设置,或在.Rprofile文件中永久配置。apt可通过命令行选项或配置文件设置代理。还介绍了判断代理生效的方法及获取代理服务器的途径,包括自行搭建或使用第三方服务。
2025-06-10 14:49:01
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原创 让你的服务器拥有时空穿梭的能力
西柚云大禹系统支持云快照功能了,最高支持天级快照,每天凌晨快照一次,相当于每天一个存档点。假如用户自己误操作导致误删除文件,由于服务器的高速写入,文件已经被覆盖无法恢复,后续通过云快照功能可以成功恢复文件。
2025-06-03 16:17:36
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原创 新版大禹系统使用教程
西柚云新大禹系统正式上线,系统经过全面重构,优化了UI和模块布局,为与官网系统融合奠定了基础,旨在提升用户体验。系统提供独立环境、灵活调度、开箱即用、数据保障和入侵防御等五大特点,确保用户数据安全与高效使用。新增XiYou AI智能编程助手,支持Rstudio中的AI对话、代码生成与注释功能。系统还提供线路检测、帮助文档、用户中心、仪表盘和云服务器管理等功能,用户可便捷管理实例、镜像和存储卷,支持实例的创建、启动、停止、重启和迁移等操作。西柚云致力于为用户提供高效、安全的云计算服务。
2025-05-15 11:30:00
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原创 【高手局】怎么在Rstudio中debug
R生态很吸引人的一点是其有非常多的R包可以使用,但是有时候我们使用这些R包的函数的时候,其磨磨蹭蹭半天不出结果,有时候真的很想钻进函数里面看下代码们到底在干什么。那么有方法可以钻进函数里面一探究竟吗,有的兄弟有的,这就是debug技术。debug技术是我们进阶的必备基础技能,这个技能也是通用的技能,可以横向拓展到其它编程语言。下面我们一起学习一下如何在Rstudio中debug。
2025-04-24 11:30:00
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原创 Rstudio接入Deepseek保姆级教程
前段时间西柚云推出的Rstudio AI编程R包,吸引了很多同学尝试使用,有部分同学反馈安装步骤比较难懂。下面我们将针对最近收集到的常见问题,进行更详细的介绍。我们非常欢迎大家使用这个工具,向我们提出宝贵的意见以及建议,这个工具免费给大家使用,大家请放心使用,不用担心Token用完。
2025-04-22 12:00:16
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原创 生信的福音!Rstudio接入Deepseek,开启自动编程新时代
- 近些年的AI大模型实在是火热,AI在知识搜索与总结方面给我们节约了不少时间。西柚云结合大家对AI编程以及日常运行任务时的实际需求,采百家之长,推出了不用魔法上网就能使用的Rstudio编程实用小工具。入口地址:https://dayu.xiyoucloud.net/#/agentTutorials
2025-04-11 13:30:18
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原创 怪谈级别疑难问题收录
本文讨论了生信分析中常见的软件问题及其解决策略,包括R及其生态系统中的bug排查、环境管理工具的使用,以及特定软件问题如CellChat、Rstudio、AutoDock Vina和SeuratV5的案例分析。
2025-04-03 12:00:00
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原创 Rstudio如何使用Conda环境配置的R
Rstudio作为一款流行的R语言集成开发环境(IDE),为用户提供了便捷的编程体验。然而,不同项目可能需要不同版本的R,这就需要我们灵活切换R版本。除了在之前文章中提到的的方法之外,今天给大家介绍另一种方法:通过创建 Conda 环境并修改 Rstudio 配置来使用 Conda 环境中配置的 R 版本。这种方法可以灵活地切换 R 版本,以适应特定项目的需求。
2025-03-28 12:00:00
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原创 任务忘了用nohup挂后台了怎么办
在 Linux 系统中,我们如果需要运行一些长时间的任务,可以使用 nohup 命令将任务放到后台运行,以避免因终端关闭而导致任务中断。但如果在运行任务时忘记使用 nohup,已经把任务运行起来了,又不想终止后再重新运行挂后台,如何将已经运行的任务放到后台呢?
2025-03-21 12:00:00
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原创 我们可能用错Rstudio了
本文介绍了RStudio启动缓慢的原因及解决方法,包括关闭自动注销、保持浏览器登录、使用后台任务运行和通过Linux终端执行代码等优化技巧。
2025-03-13 14:45:39
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原创 VS Code连接服务器教程
VS Code(全称 Visual Studio Code)是一款由微软推出的免费、开源、跨平台的代码编辑神器。VS Code 支持 所有主流操作系统,拥有强大的功能和灵活的扩展性。
2025-03-08 16:29:19
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原创 怎么让命令后台运行之拓展篇
之前在西柚云公众号发表的这篇文章里说到Jupyter、Rstudio等软件后台运行的方法和nohup、screen等命令的使用,今天我们就来补充一下screen命令的几个常见问题以及另一个后台运行命令——tmux命令的使用。
2025-02-28 22:11:21
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原创 怎么使用服务器运行pySCENIC
本文我们整理了在服务器上运行pyscenic的三个方法供大家参考,分别是conda安装pyscenic运行、arboreto_with_multiprocessing运行、容器化运行。
2025-02-14 13:27:53
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原创 Jupyter占用内存高问题排查解决
面对交换内存占用过高的问题,关键在于快速识别和处理占用资源的程序。本篇文章让我们能够有效地定位和解决内存占用问题,保持服务器的高效运行。记得定期检查和优化程序,以避免未来的内存溢出。
2024-12-27 18:00:42
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原创 Linux病毒大扫除:值得收藏的病毒查杀技巧
希望大家重视自己的服务器安全问题,按照我们的教程落实防护工作。本文总结了Linux服务器病毒查杀的多个思路和技巧,值得收藏转发以备不时之需
2024-12-18 17:20:43
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原创 这可能是GitHub R包安装的最优方法
西柚云镜像站聚合了多种资源仓库,涵盖常用静态资源文件、Docker镜像仓库、Conda仓库、APT仓库、CRAN仓库等,且其独有的GitHub R包代理,能加快devtools和remotes安装R包的速度,为生信科研助力,不再为网络问题无法安装软件而烦恼。各种仓库的使用教程,可以参考西柚云公众号以往发布的文章《西柚仓库集合》或者依据镜像站内的指引使用。
2024-12-09 15:06:18
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原创 x86_64-conda-linux-gnu-cc not found
可是在 conda 的对应目录中这个 x86_64-conda-linux-gnu-cc 是已经安装好的。更奇怪的是,这个包在 R 的交互环境中可以安装好(在终端中输入 R,然后执行相关的装包代码),而在 rstudio 中运行相应的装包代码是却会出现报错。这里的 CC 看起来是一个变量,最后我在该文件的第 16 行找到了它,它的值是 x86_64-conda-linux-gnu-cc, 我将它改为了 x86_64-conda-linux-gnu-cc 这个文件的绝对路径,这样就不会报错。
2023-02-08 23:06:11
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原创 Linux教程之用户和用户组管理
用户和用户组是用来划分权限的抽象概念,用户除了作为权限的抽象之外。我们通常还需要借助用户名和密码来登陆系统。用户和用户组是多对多的关系,即1个用户可以对应多个用户组,1个用户组也可以包含多个用户。
2022-12-31 17:40:57
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原创 Linux教程之进程的后台运行(&,bg, fg, jobs, nohup)
Linux教程之进程的后台运行(&,bg, fg, jobs, nohup)
2022-11-20 22:10:29
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原创 《数据保护指南-下》——使用Git保护代码
本教程教你使用Git保护自己的代码,Git是一个分布式版本控制系统,很多高级功能,团队协作中更是不可缺少它。实际上我们在这里使用Git的目的就是作为代码备份,操作是比较简单的。
2022-11-17 10:02:37
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原创 《数据保护指南-上》——前言与trash命令
在Linux服务器上面,我们有时候会误删数据,导致数据无法找回。本教程介绍使用trash命令、git工具保护我们自己的数据。
2022-11-16 21:27:53
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原创 Linux教程之压缩文件(tar,zip,7z ,rar,gzip,bzip2)
Linux教程之压缩文件(tar,zip,7z ,rar,gzip,bzip2)
2022-11-14 16:46:59
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原创 Linux教程之查找文件(find,ls,locate,whereis,which)
## 查找文件(find,ls,locate,whereis,which)
2022-11-08 12:18:35
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原创 Linux教程之查看文件(cat,head,tail,less,more)
linux 查看文件内容(cat,head,tail,less,more)
2022-11-07 11:52:23
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