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原创 如何安装pytorch

简单记录了一下如何安装pytorch

2025-03-06 19:22:58 612

原创 单细胞文献学习--CrossChat推断和分析分层次的细胞细胞通讯结构

单细胞文献学习,CrossChat一款推断和分析分层次的CCC结构的新工具

2025-02-05 00:27:55 858

原创 PCA(Principal component analysis) 学习笔记

本学习笔记介绍了PCA的基本直观,以及三种对于PCA的不同看法。

2024-11-04 22:48:08 1473

原创 从单细胞和空间转录组学推断模式驱动的细胞间流动(Flowsig)--生信算法笔记

今天来介绍一下聂老师组的8月分出版的这篇推断细胞间流动网络的文章《从单细胞和空间转录组学推断模式驱动的细胞间流动》。本文提供了一种新的ST数据细胞间信号流动模式推断方法(Flowsig),也可以用于scRNA-seq中。

2024-10-17 19:23:50 2551

原创 scRNA-seq和ST数据中常用的降维方法以及非负矩阵分解模型整理

本文是作者参考Nonnegative spatial factorization applied to spatial genomics并加入了一些在自己的理解,梳理了一下目前scRNA-seq和ST空间转录组中常用的一些降维方法和非负矩阵分解的模型。

2024-10-16 21:34:15 936

原创 科普向-计算机如何生成随机数?(第二期)

本系列会从特殊到一般说明计算机是如何生成随机数,并介绍一些常见的方法。本期介绍了就正态分布以及一般函数而言,如何利用舍取法生成分布。并介绍了一种常用的覆盖函数rescaled Cauchy function。

2024-09-17 21:23:30 886

原创 科普向-计算机如何生成随机数?(第一期)

本系列会从特殊到一般说明计算机是如何生成随机数,并介绍一些常见的方法。本期介绍了均匀分布,指数分布,和一些分布函数比较”好“的分布的生成方法。对于最常见的正态分布和一般的分布函数的生成方法会在下一期和大家分享~

2024-09-16 22:39:45 3601

原创 Randomized Linear Algebra 中的矩阵乘法例子

介绍了一种Randomized Linear Algebra 中的矩阵乘法的例子,对其可行性和收敛性进行了初步的评估。

2024-09-13 22:17:29 905

原创 数值积分中关于复化中点法(Composite Midpoint Rule)的收敛阶推导

数值积分中关于复化中点法(Composite Midpoint Rule)的全局误差以及收敛阶推导

2024-09-13 19:32:01 859

原创 Vscode环境配置(+Anaconda+Jupyter+py+R 懒人包)

简单写了下VSCode和anaconda配置方法,大概就是在vscode环境里创建一个Jupyter可以在里面同时写py和r,还可以选择不同的kernel虚拟环境,个人感觉挺方便的,有点类似懒人包

2024-09-12 22:21:06 3089 2

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