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原创 用org.HS.eg.db进行SYMBOL\GENENAME\ENTREZID的转换
######################entrezID转换###############################################教程:B站不吃糖的康康《ensembl_ID转换》################library(org.Hs.eg.db)keytypes(org.Hs.eg.db)#####查看org.Hs.eg.db中可以被选择/使用的类型setwd("C:/Users/HUAWEI/Desktop/Rdata/bss/GSEA")gsea &l
2023-11-22 14:47:28
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原创 代码:DESeq2包做转录组RNAseq差异分析
3.counts列表里的read counts需要为整数。因此在excel种用ROUND函数四舍五入取整。1.报错:Error: unexpected ')' in " )"2.数据选择read counts,注意不是FPKM。1.第一列选取gene_id,不然会有重复项。跟括号没关系,其实是代码忘加逗号。制作group.vsc。4.第一列不能有表头。遇到跑不通的多跑几次。
2023-09-01 00:07:14
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空空如也
空空如也
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