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原创 编写一个程序,从纯文本文件中读取DNA序列。计算每个碱基出现的频率。该程序还需给出最常见碱基的出现频率。附加GC含量计算。
如题,《python生物信息学数据管理》的一道练习。这是V1版本的改进版:V2。
2025-03-07 08:13:08
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原创 编写一个程序,从纯文本文件中读取DNA序列。计算每个碱基出现的频率。该程序还需给出最常见碱基的出现频率。附加GC含量计算。
如题,出于《python生物信息学数据管理》的一道练习。已解决,或有疏漏,欢迎讨论!
2025-02-13 00:45:52
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原创 R:filter() masks 和Error in class == “subcompact“ : comparison (==) is possible only for atomic错误。
如题,反复确认了源码无误,运行却显示函数参数有误。顺利解决问题的同时,也顺带了解到了R包加载顺序如此重要的原因。
2025-02-11 17:12:14
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原创 在vscode中,设置R plot图片的宽高比例/横纵坐标轴比例
点击vscode左下角“齿轮”即管理按钮并选择“设置”选项(或者直接command + ,)→ 在“设置”页面的搜索框输入“plot” → 下拉找到“R>Plot: Dev Args”,并将其中的width和height的值改为一致 → 重启vscode。:R代码中已经将横纵坐标轴的刻度和长度参数设置为一样,但plot出的图片却一直是长方形,整个绘制的图形横纵坐标轴比例明显不协调,有一样的刻度却没有一样的长度。:vscode为R Plot图片设置了默认宽高,找到相关设置并将宽高设置为一样即可。
2025-02-08 04:22:53
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原创 Mac/Windows中使用vscode运行R plot不显示图片的可能原因和解决办法
有可能是直接点击了代码编辑窗口右上角“播放键”来运行所致,解决办法是使用快捷键更换代码的执行方式。
2025-02-08 03:30:45
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原创 Mac中R/Rstudio出现“Warning: You‘re using a non-UTF8 locale, therefore only ASCII .....”的解决办法
解决办法分两步:第一步将Mac的locale永久设置为UFT-8;第二步修改R执行环境的语言。
2025-02-07 22:21:34
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原创 MacOS Aria2GUI配置
MacOS Aria2GUI配置(Catalina10.15)报错情况:下载并安装Aria2GUI for Mac后,打开显示internal Service Error;同时Chrome浏览器里的插件aria2 for Chrome 显示Disconnected。解决办法:sudo aria2c --enable-rpc --rpc-listen-all=true --rpc-allow-origin-all...
2021-06-07 10:53:49
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原创 Python问某星自动抢讲座
背景:学院讲座可以加期末综测分,而综测分关系奖学金评比,所以每场讲座火爆。为了限制听讲人数,学院开始更换讲座报名预约形式:定时发放问卷星,截取最先提交的几十名或者一百名为成功报名的人。使用python+selenium即可实现,但后面发现问某星会检测selenium并需要滑块验证,解决方法为屏蔽检测;寻找滑块元素自动点击。from selenium import webdriverfrom time import sleepfrom selenium.webdriver.chrome import
2021-03-22 14:49:43
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原创 Linux/MacOS下安装BioPerl
#安装perlbrew,安装完需要source一下wget -O - https://install.perlbrew.pl | bash#安装安装cpanmperlbrew install-cpanm#安装Bio::Perlcpanm Bio::Perl注:如果有模块报错或者版本过旧,则先安装即可。例如,当提示Test::More 模块版本太老,则可用命令cpan “install Test::More”先安装。我的提示是Bio::DB::GenPept 和Bio::DB::GenB
2021-03-22 09:38:40
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空空如也
空空如也
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