pconsc4下载-所需环境配置

最新推荐文章于 2025-05-30 10:05:16 发布
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按照下面这篇文章安装
参考文章
主要是按以下这个步骤
在这里插入图片描述
如果还是安装不了，对照以下图片安装相应版本
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述在这里插入图片描述(https://img-blog.csdnimg.cn/f840663139a0496495a92ed174b23a67.png)
在ubuntu18上下载成功
在autodl上也成功

pcons-fold:使用PconsC和Rosetta进行蛋白质折叠的管道
05-18
PconsFold 使用来自PconsC的预测接触和Rosetta折叠协议进行蛋白质折叠的管道。 您可以在底部找到补充数据，例如蛋白质ID，序列，天然和预测的结构，预测的联系方式。 管道概述： 输入：包含一个蛋白质序列的fasta文件 准备PconsC的输入 使用PconsC进行联系预测 准备用于Rosetta折叠的输入 罗塞塔折叠 提取和放松具有最低Rosetta能量的结构 输出：预测的联系图（也作为图）和排名最靠前的结构模型（松弛和非松弛） 依存关系： MATLAB v8.1或更高版本 或 需要MATLAB才能运行plmDCA。 但是，如果无法使用MATLAB，则还可以使用plmDCA的编译版本。 要运行已编译的版本，您需要提供MCR的路径。 如何运行： 确保所有依赖项均正常运行，并调整localconfig.py的路径。 要运行完整的管道，请使用： ./pcons_f
论文解读：基于图神经网络与蛋白质接触图的药靶亲和力预测（一）2021SC@SDUSC
chy931088287的博客
11-09 1万+
2021SC@SDUSC 论文解读：基于图神经网络与蛋白质接触图的药靶亲和力预测（一） Drug–target affinity prediction using graph neural network and contact maps 摘要 计算机辅助药物设计是利用高性能计算机模拟药物设计任务的一个很有前景的研究领域。药物靶标亲和度(DTA)预测是计算机辅助药物设计中最重要的一步，可以加快药物开发速度，减少资源消耗。随着深度学习的发展，将深度学习引入到DTA预测中，提高DTA预测的准确性已成为研究的热点
pconsc4 安装
Qy_sfsh的博客
08-14 890
因为是Ubuntu 18.04 所以这里没有用yum 安装。我的系统版本： Ubuntu 18.04.4 LTS。这里的python 环境是： 3.7。
安装pconsc4时候出现ERROR: Failed building wheel for pyGaussDCA
weixin_45949524的博客
03-16 723
有伙伴知道这个错误是什么原因导致的吗，倒腾好几天了一直没有解决
2021SC@SDUSC软件工程应用与实践07----hhblits与Pconsc4的配置
m0_55985367的博客
11-17 1604
2021SC@SDUSC
2021 RSC | Drug–target affinity prediction using graph neural network and contact maps
发呆的比目鱼的博客
07-03 1654
2021 RSC | Drug–target affinity prediction using graph neural network and contact maps
PyPI 官网下载 | pkg_common-0.4.tar.gz
01-14
标题中的“PyPI官网下载 | pkg_common-0.4.tar.gz”表明这是一个在Python Package Index (PyPI) 官网上可以找到的软件包，名为`pkg_common`，版本为0.4，其分发格式是tar.gz。PyPI是Python社区广泛使用的软件仓库，...
ERROR: Could not build wheels for pconsc4, pyGaussDCA, which is required to install pyproject.toml-based projects
11-26
这个报错通常是由于缺少一些必要的依赖项或者编译器问题导致的。你可以尝试以下几种方法来解决这个问题： 1. 确保你的系统中已经安装了必要的编译器和依赖项，例如gcc、python...conda install pconsc4 pyGaussDCA ```
PConsC2在Python环境中实现机器学习蛋白质接触预测
综上所述，PconsC和PconsC2工具在Python环境下，利用机器学习技术对蛋白质结构进行接触预测。学习和应用这些工具不仅需要掌握Python编程语言，还需要了解机器学习的基础知识、生物信息学的数据处理方法，以及蛋白质...
PconsC2深度学习技术优化蛋白质接触预测
'PconsC2-master'是该工具的压缩包子文件名称，用户可以从该压缩文件中提取出所需的所有文件和目录结构，以便安装和使用。 以上知识点详细阐述了PconsC2这款蛋白质结构预测工具的工作原理、操作环境、依赖性以及...
DEEPCON: protein contact prediction using dilated convolutional neural networks with dropout
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今天真的要开始正式进入科研状态了，之前一直都进入失败，咳！，那就先来看一篇相关领域的论文吧 —————————————————————————————————————————————— 题目：DEEPCON: protein contact prediction using dilated convolutional neural networks with dropout doi: 10.1093/bioinformatics/btz593 ...
2021SC@SDUSC软件工程应用与实践05----药物与蛋白质的图表示
m0_55985367的博客
11-04 427
2021SC@SDUSC 一，导语 近年来，随着图结构数据的出现，许多方法都集中在图的表示和学习上，因此基于图的研究取得了很大进展。 与网格状结构数据相比，图结构数据通常处于不规则域中，这使得更难以准确地表示图的特征。 二，参考文献 Drug-target interaction prediction using multi-head self-attention and graph attention network PconsC4: Fast, accurate and hassle..
AI编程在BOSS项目的实践经验分享
weixin_51517346的博客
05-30 901
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