脑机接口社区公众号文章《脑电分析系列[MNE-Python-9]| 参考电极应用》pycharm+python3.8.0学习记录

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本文记录了作者在学习脑机接口社区文章《脑电分析系列[MNE-Python-9]| 参考电极应用》时，使用Pycharm+python3.8.0遇到的问题。主要问题是运行结果的图与原文有差异，数据集大小和信号类型不符，以及matplotlib图表字体大小无法调整。作者怀疑是原始数据对象被修改或版本差异导致，并尝试修改代码但未解决字体大小问题。

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脑机接口社区文章《脑电分析系列[MNE-Python-9]| 参考电极应用》pycharm+python3.8.0学习记录及问题分析

出自“脑机接口社区”文章——《脑电分析系列[MNE-Python-9]| 参考电极应用》，感谢公众号文章分享！

Env： Pycharm+python3.8.0

文章源码：

# 脑电分析系列[MNE-Python-9]| 参考电极应用

"""
参考电极
MNE-Python中的平均参考设置
set_eeg_reference(self,
                  ref_channels='average',
                  projection=False,
                  ch_type='auto',
                  verbose=None)
指定用于EEG信号的参考
"""

"""
默认情况下，MNE-Python将自动重新参考EEG信号，
以使用平均参考（请参见下文）。 这个函数可以显示指定所需的EEG参考。
这可以是现有电极或新的虚拟通道。 此函数将根据所需参考重新参考数据，
并防止MNE-Python自动添加平均参考投影。

一些常见的参考方案以及ref_channels参数的相应值如下：

无需重新引用(No re-referencing)：  

如果EEG数据已经在使用正确的参考信号，
则设置ref_channels = []。
这将阻止MNE-Python自动添加平均参考投影。

平均参考(Average reference)：  

通过设置ref_channels ='average'
来对当前EEG信号进行平均，创建一个新的虚拟参考电极。   

如果在info['bads']中设置了错误的EEG通道，
则会自动排除它们。

单电极(A single electrode)：  

将ref_channels设置为包含将用作新参考的通道名称的列表，
例如ref_channels = ['Cz']。

多个电极的平均值(The mean of multiple electrodes:)：  

通过计算从两个或多个选定通道记录的当前EEG信号的平均值，
可以创建一个新的虚拟参考电极。  

将ref_channels设置为通道名称列表，指定要使用的通道。   

例如，要使用平均乳突参考，在使用10-20命名方案时，
请设置ref_channels = ['M1'，'M2']。
"""

import mne
from mne.datasets import sample
from matplotlib import pyplot as plt

# 数据文件存放地址
data_path = sample.data_path()
raw_fname = data_path + '/MEG/sample/sample_audvis_filt-0-40_raw.fif'
event_fname = data_path + '/MEG/sample/sample_audvis_filt-0-40_raw-eve.fif'
event_id, tmin, tmax = 1, -0.2, 0.5

# 读取fif文件，并生成raw对象
raw = mne.io.read_raw_fif(raw_fname, preload=True)
events = mne.read_events(event_fname)

# 将绘制脑电通道，以可视化参考方案中的差异。
picks = mne.pick_types(raw.info,
                       meg=False,
                       eeg=True,
                       eog=True,
                       exclude='bads')

"""
下面将应用不同的EEG参考方案，并绘制所产生的诱发电位。
注意，当使用mne.Epochs构造epochs时，这里提供proj =
True参数。
这意味着将自动应用所有可用的projector(投影)。
具体来说，如果存在由raw.set_eeg_reference(
'average'，projection = True)
设置的平均参考投影机，
则MNE在创建epochs(时间片段)时会应用此projector(投影)。
"""

reject = dict(eog=150e-6)
epochs_params = dict(events=events,
                     event_id=event_id,
                     tmin=tmin, tmax=tmax,
                     picks=picks,