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原创 分享一下简单使用的R基础语言
符号表示从dataframe中抽取列,符号表示从R的类实列中读取数据,如bgxcolors符号表示从dataframe中抽取列,@符号表示从R的类实列中读取数据,如`bg = x@colors符号表示从dataframe中抽取列,符号表示从R的类实列中读取数据,如bgxcolorsbg.col`意为从x中取出colors,而colors本身又是dataframe,所以需要用$进一步提取其中的bg.col这一列。
2023-08-11 02:00:13
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原创 富集分析实战
这是因为,传统的富集分析根本不需要考虑基因表达量的变化趋势,其算法的核心只关注这些差异基因的分布是否和随机抽样得到的分布一致,即使后期在可视化时,我们在通路图上用不同颜色标记了上下调的基因,但是由于没有采用有效的统计学手段去分析这条通路下所有差异基因的总体变化趋势,这使得传统的富集分析结果无法回答上述的问题。当然还有些朋友得到了GO,KEGG的结果之后,想要自己展示一些个性化的通路或者疾病富集分析,我们拿KEGG举例,当然GO也可以使用相同的操作。如果达到这个标准的基因作为候选分析的基因。
2023-07-14 01:24:40
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原创 【无标题】
你好! 这是你第一次使用 Markdown编辑器 所展示的欢迎页。如果你想学习如何使用Markdown编辑器, 可以仔细阅读这篇文章,了解一下Markdown的基本语法知识。我们对Markdown编辑器进行了一些功能拓展与语法支持,除了标准的Markdown编辑器功能,我们增加了如下几点新功能,帮助你用它写博客:撤销:Ctrl/Command + Z重做:Ctrl/Command + Y加粗:Ctrl/Command + B斜体:Ctrl/Command + I标题:Ctrl/Command + S
2023-06-20 15:19:41
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原创 Legenddyx的生信日记
在生物信息学领域我有三年的学习经验,生物信息学全基因组的bulk RNA测序我个人已经有三年的学习和应用经验了,同时也发表了多篇生信论文(也帮助许多同学发表了一些包含生信分析的论文),如果有小伙伴对普通转录组上下游分析或者蛋白组下游分析感兴趣的,可以关注我后面的学习系列。相信大家关注这个号也是奔着学习的目的来的,但在生信学习系列的头篇,我还是啰嗦几句,讲点废话。我的生信日记开始与大家见面了,哈哈。
2023-06-20 15:19:05
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空空如也
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