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RSS订阅原创 一文详解GATK-HaplotypeCaller 变异检测原理和实战
要点1. GATK-HaplotypeCaller简介2. GATK-HaplotypeCaller的基本组装原理3. GATK-HaplotypeCaller的安装和使用4. GATK-HaplotypeCaller实战hello，大家好，今天为大家带来关于变异检测工具GATK-HaplotypeCaller超详细安装及应用教程。我们将持续为大家带来生物医疗大数据分析一文详解系列文章，欢迎大家关注并星标我们，可以更及时的看到我们的文章哦。1.GATK-Haplot..
2022-03-22 18:04:39
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原创 软件前沿：泛基因组学映射工具Giraffe
hello，大家好，今天为大家带来关于软件工具前沿 - 泛基因组学映射工具Giraffe的超详细介绍及应用教程。
2022-03-06 20:49:10
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原创 一文详解VarScan肿瘤体细胞突变检测的的安装和实践
hello，大家好，今天为大家带来关于肿瘤体细胞突变检测工具VarScan的超详细安装及应用教程。
2022-03-01 13:59:34
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原创 一文详解宏基因组组装工具Megahit安装及应用
要点 Megahit简介 Megahit的基本组装原理 Megahit的安装和使用 Megahit实战 hello，大家好，今天为大家带来关于宏基因组组装工具Megahit的超详细安装及应用教程。我们将持续为大家带来生物医疗大数据分析一文详解系列文章，欢迎大家关注，可以更及时看到文章哦。一、Megahit简介Megahit是一款超速的宏基因组从头组装工具，由港大—华大基因联合实验室（HKU-BGI）开发，和其他基因组组装软件相比，Megah.
2022-02-22 14:03:57
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原创 一文详解基因组denovo组装原理和实战
面向未来生物医疗数据挖掘应用场景下，如何实现数据计算或挖掘的 可扩展性，可重用性，可视性，伸缩性，高保真性。关于更多生物医疗大数据分析工具和软件的介绍和使用请看六点了官网[1]。图文：心如止水 编辑 marple目录1、基因组组装2、基于De-Bruijn Graph的组装算法3、SOAPdenovo的安装和使用说明：安装、说明、配置、运行4、SOAPdenovo案例实战：数据下载、配置、运行、输出写在前面大家好，这是我们六点了给大家介绍生物信息大数据分析 基因组数据分.
2022-02-17 20:16:14
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原创 关于CWL来创作和分析的优势
Sixoclock 是一个提供可重用、模块化、可视化生物医疗数据处理算法的云协作平台。通过使用sixoclock，你将快速获取可靠的数据处理软件、流程，并通过在线的可视化参数配置界面完成软件参数的设置、软件的下载，利用本地计算设备，完成一键下载，一键运行。Sixoclock诞生的初衷是为了: 简化数据分析复杂度，使任何人都可以轻松进行数据分析操作。 提高数据分析流程在科研与产业界共享以及重用重现的便利性。 Sixoclock 以CWL和docker为基础。你可以使用CWL来创建...
2021-12-23 17:25:27
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原创 linux版本下的超简单的生信分析平台介绍
Sixbox-linux，也就是sixbox的linux版本，来实现本地linux机器、集群等linux服务器的快速部署和使用。Sixbox-linux现在已经开放使用，欢迎大家到官网安装使用！同时有更好的使用体验，这里为大家详细展示从安装、配置到使用的所有要点。安装：下载、配置文件、CWLdb （workflow仓库）使用：读写配置文件、运行CWL、从仓库中获取CWL流程、查看CWL流程、提交CWL流程到仓库、修...
2021-12-23 17:22:52
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原创 生信分析-手把手做nature新冠文章分析
今天要给大家安利一款超实用的科研数据库-sixoclock云平台。为了满足用户科研分析的多种需求，该平台的开发者创建的“流程协作”功能，能够轻松实现这一目的。用户仅需对单个软件拖拽，即可形成个性化定制的数据处理工作流程。2019年末一场悄无声息的战争拉开序幕，名为新冠肺炎的病毒引发了全球健康危机，世界各地的人为此感到恐慌。许多国家实施了最为严格的人口流动管控政策，各大研究机构纷纷加入新冠病毒相关研究。尽管目前已经有相当有效的疫苗在很大范围的人群内接种，但由于新冠病毒突变速率之快，对它的研究仍然是
2021-12-23 17:21:01
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原创 如何使用步骤简单并可视化的生信分析软件或者平台-sixclock分享
sixoclock运作机制，并结合一个案例展示通过sixoclock处理数据的过程。
2021-12-23 17:19:19
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