众所周知,ggbiplot是一款PCA分析结果可视化的R包工具,但是在安装的时候经常会出现一些问题,直接
install.packages("ggbiplot")
他会报错或者警告你没有安装rtools工具,我当时安装的时候就是出现了这个问题,在这里分享一下我的解决方法;
我遇到的问题是需要安装Rtools,由于我的R版本是4.0.5,这里提供的是rtools40版本
下载地址:
https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/rtools40-x86_64.exe
根据安装指引走,最好与Rstudio安装在同一目录下,安装完成后,在Rstudio中配置好环境
##设置rtools的工作环境
writeLines('PATH="${RTOOLS40_HOME}\\usr\\bin;${PATH}"', con = "~/.Renviron")
Sys.which("make")
此时,rtools的环境就配置好了,接下来安装devtools和相应的编辑包usethis
install.packages("devtools")
install.packages("usethis")
library(devtools)
然后是安装github上的ggbiplot包,先载入相应的依赖包,再载入ggbiplot就可以使用了
install_github("vqv/ggbiplot")
library(ggplot2)
library(plyr)
library(scales)
library(grid)
library(ggbiplot)
##下面就可以正常使用ggbiplot画图工具啦
综上,就是我的解决方法啦!!!
第一次写稿,请多多支持