- 博客(8)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 torch-geometric成功安装记录
然后再次克隆了之前高版本能运行的环境，删除掉torch、torch-geometric、4个相关组件、cudatoolkit，然后按照、 torch1.7.0（conda安装同时安装了cuda）、4个小组件、torch-geometric的顺序再次安装。之后我发现对应版本的torch-geometric需要用低版本的cuda，于是去安装对应的cuda和cudnn，但是由于一个ubuntu使用多个cuda需要软连接，这次安装我这个好像弄错了，所以又没跑成功。找对应的pytorch、cuda版本装。
2023-07-30 22:11:30
503
5
转载 SSH远程服务器使用jupyter
其中： -N 告诉SSH没有命令要被远程执行；-f 告诉SSH在后台执行；-L 是指定port forwarding的配置，远端端口是8889，本地的端口号的8888。还是习惯在本地用jupyter，于是就想着在本地用服务器的jupyter。
2023-07-07 21:42:00
522
1
原创 在远程服务器上运行tensorboard，并在本地浏览器查看
这是因为链接访问的是服务器本地端口，而我在本地浏览器输入网址，当然找不到目标ip。我们需要建立本地服务器与远程服务器的通信，将tensorboard的。然后点击服务器输出的链接，会发现在本地浏览器上打不开，显示。“无法访问此网站，找不到IP地址”。
2023-07-07 17:27:51
1174
1
原创 复现PatchGCN记录
就可以了，打开是包含患者信息的csv，有非常多种类的信息，里面也有censorship以及survival_months。应该是从CLAM得到h5文件（包含patch的坐标和特征），然后再用那个ipynb构建图数据。然后参照PatchGCN的WSI-Graph Construction.ipynb，进行图的构建。然后运行main文件，注意main里面的--data_root_dir，给到正确的路径。参照CLAM，提取特征，得到包含patch坐标和1024维特征的h5文件。所以现在的问题是怎么提取特征？
2023-06-18 17:51:52
845
21
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人